More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0212 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  66.6 
 
 
538 aa  763    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  68.9 
 
 
540 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  68.43 
 
 
540 aa  748    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  62.17 
 
 
539 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
538 aa  1110    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  69.29 
 
 
540 aa  753    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  34.79 
 
 
520 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  32.88 
 
 
544 aa  259  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 
544 aa  257  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  31.03 
 
 
534 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  32.44 
 
 
535 aa  252  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  32.34 
 
 
524 aa  237  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 
531 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  31.92 
 
 
512 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  31.92 
 
 
512 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  31.92 
 
 
512 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  31.72 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.47 
 
 
544 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  31.52 
 
 
512 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
531 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 
536 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.12 
 
 
512 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.92 
 
 
512 aa  223  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  34.44 
 
 
532 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 
532 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.73 
 
 
512 aa  221  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.73 
 
 
512 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.73 
 
 
512 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 
531 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
512 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  29.54 
 
 
512 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  29.54 
 
 
512 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.7 
 
 
493 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  31.27 
 
 
514 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  30.69 
 
 
521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  33.41 
 
 
547 aa  217  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 
520 aa  217  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
538 aa  216  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  31.02 
 
 
523 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.15 
 
 
520 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.08 
 
 
517 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 
520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  31.29 
 
 
514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 
520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 
547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  30.45 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 
520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 
547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
520 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
520 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 
528 aa  213  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.06 
 
 
535 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.32 
 
 
528 aa  213  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  31.73 
 
 
531 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  30.85 
 
 
535 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  30.85 
 
 
535 aa  212  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.85 
 
 
535 aa  212  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
520 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  30.85 
 
 
535 aa  212  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  30.85 
 
 
535 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  33.26 
 
 
541 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.85 
 
 
535 aa  212  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.85 
 
 
535 aa  212  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  31.32 
 
 
533 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.56 
 
 
520 aa  211  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  32.21 
 
 
532 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 
528 aa  210  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  31.43 
 
 
532 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
520 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.66 
 
 
520 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.66 
 
 
520 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
520 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.47 
 
 
526 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  34.39 
 
 
537 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.66 
 
 
520 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.47 
 
 
526 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.47 
 
 
526 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.47 
 
 
526 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  30.66 
 
 
520 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.66 
 
 
520 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.66 
 
 
520 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
512 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.66 
 
 
520 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
520 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
519 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.25 
 
 
526 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 
553 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 
535 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
529 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
532 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 
531 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 
535 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.8 
 
 
520 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  32.01 
 
 
532 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 
531 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 
534 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>