47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4222 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1311    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  42.46 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  29.98 
 
 		 642 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  30.18 
 
 		 364 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4465  hypothetical protein  48.74 
 
 		 120 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  19.82 
 
 		 587 aa  81.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  21.15 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  30.09 
 
 		 673 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  24.88 
 
 		 662 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  27.4 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  23.76 
 
 		 671 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  31.82 
 
 		 774 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  28.92 
 
 		 774 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  26.98 
 
 		 773 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  32.03 
 
 		 771 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  34.75 
 
 		 994 aa  57.4  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  28.23 
 
 		 651 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  26.52 
 
 		 946 aa  52  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  25 
 
 		 630 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  25.93 
 
 		 603 aa  48.9  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  34.13 
 
 		 838 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  19.84 
 
 		 610 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  26.94 
 
 		 361 aa  48.5  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_432  predicted protein  27.08 
 
 		 829 aa  47.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0880854  normal  0.487842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  26.57 
 
 		 702 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  29.41 
 
 		 647 aa  47.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  31.34 
 
 		 667 aa  47.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  29.41 
 
 		 635 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.29 
 
 		 631 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  30.77 
 
 		 636 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  26.45 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  30.99 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02500  ATPase, putative  24.71 
 
 		 939 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.791376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  35.35 
 
 		 682 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  27.19 
 
 		 997 aa  45.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  34.72 
 
 		 605 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  30.17 
 
 		 987 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  29.49 
 
 		 655 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  31.08 
 
 		 589 aa  44.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  31.58 
 
 		 652 aa  44.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  29.11 
 
 		 691 aa  44.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 		 608 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  29.27 
 
 		 612 aa  44.3  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  28.57 
 
 		 632 aa  43.9  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  31.08 
 
 		 628 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  22.88 
 
 		 622 aa  43.9  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00126  DNA mismatch repair protein Mlh1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11700)  24.59 
 
 		 744 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>