More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1120 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 303 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 348 aa  191  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.34 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.51 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  35.21 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  35.68 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 		 241 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 338 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 341 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  28.82 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.18 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  30.13 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.97 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  29.24 
 
 		 339 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  27.02 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  29.52 
 
 		 332 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  37.1 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  27.83 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.91 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 581 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 703 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  28.84 
 
 		 237 aa  89.7  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 372 aa  88.2  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 365 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 367 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  39.83 
 
 		 597 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 347 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 		 1035 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.9 
 
 		 337 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.81 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 573 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.36 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.61 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.1 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.38 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  28.11 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 1171 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>