More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1955 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
484 aa  982  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
466 aa  210  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.1534e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.48 
 
 
463 aa  182  9e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  41.85 
 
 
391 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  42.17 
 
 
392 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  41.2 
 
 
257 aa  177  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  39.92 
 
 
416 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
406 aa  174  3e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 
587 aa  172  8e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
585 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  41.77 
 
 
412 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
621 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
467 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.27 
 
 
456 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  44.74 
 
 
599 aa  170  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.22 
 
 
477 aa  170  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
468 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  44.3 
 
 
587 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.43 
 
 
397 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  44.3 
 
 
587 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  44.3 
 
 
587 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  44.3 
 
 
587 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  44.3 
 
 
587 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  44.3 
 
 
587 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  44.3 
 
 
587 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  41.67 
 
 
584 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
607 aa  168  3e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  44.3 
 
 
587 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.10325e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  44.3 
 
 
587 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
423 aa  167  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  29.02 
 
 
463 aa  167  6e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.34 
 
 
463 aa  166  6e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
459 aa  166  7e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.62888e-06  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  29.02 
 
 
462 aa  166  1e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 
554 aa  165  1e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  43.05 
 
 
554 aa  165  1e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  35.61 
 
 
414 aa  166  1e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.27 
 
 
463 aa  164  2e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
585 aa  164  2e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  43.05 
 
 
565 aa  165  2e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  41.53 
 
 
347 aa  164  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
600 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.89 
 
 
468 aa  164  4e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
723 aa  164  4e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  29.27 
 
 
463 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  29.27 
 
 
463 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
621 aa  162  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
401 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.94 
 
 
461 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
463 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  40.18 
 
 
377 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  30.12 
 
 
593 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.66 
 
 
463 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
495 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  30.98 
 
 
455 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
574 aa  161  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
489 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
438 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
459 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  40.44 
 
 
401 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  31.76 
 
 
458 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
458 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
458 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
412 aa  160  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.97625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
458 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
394 aa  160  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
458 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
458 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  37.07 
 
 
387 aa  159  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
453 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  39.11 
 
 
402 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  40.09 
 
 
391 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  31.83 
 
 
458 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  37.18 
 
 
423 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
412 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  38.33 
 
 
393 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
461 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  31.76 
 
 
458 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
639 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  38.84 
 
 
406 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  36.97 
 
 
397 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  40.44 
 
 
337 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  7.36417e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.41 
 
 
486 aa  157  5e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
464 aa  157  5e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
359 aa  157  5e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  37.89 
 
 
410 aa  157  5e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
590 aa  157  5e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  31.42 
 
 
458 aa  157  5e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  25.38 
 
 
455 aa  157  5e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  25.38 
 
 
455 aa  157  5e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  32.65 
 
 
477 aa  157  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
589 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.11549e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
466 aa  156  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
599 aa  156  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  39.57 
 
 
446 aa  156  8e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
581 aa  156  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  31.49 
 
 
458 aa  156  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  31.42 
 
 
458 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  30.74 
 
 
310 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
639 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>