232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1785 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  100 
 
 		 151 aa  316  7e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  42.76 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  38.19 
 
 		 407 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2526  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  38.06 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  35.51 
 
 		 218 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  34.25 
 
 		 212 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.65 
 
 		 626 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  31.94 
 
 		 280 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  26.76 
 
 		 212 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  28.77 
 
 		 209 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  33.57 
 
 		 205 aa  94.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  28.97 
 
 		 255 aa  92.8  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  33.11 
 
 		 462 aa  91.7  3e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  29.58 
 
 		 306 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  29.17 
 
 		 214 aa  90.9  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  31.94 
 
 		 314 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  28.86 
 
 		 306 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  29.73 
 
 		 468 aa  87.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  26.35 
 
 		 200 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  31.5 
 
 		 410 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.05 
 
 		 554 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  26.71 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  30.34 
 
 		 226 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  30.87 
 
 		 312 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  30.5 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  30.66 
 
 		 193 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  30.61 
 
 		 313 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.38 
 
 		 410 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  31.43 
 
 		 204 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  31.97 
 
 		 249 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  31.76 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  31.62 
 
 		 204 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.05 
 
 		 528 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  30.61 
 
 		 213 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  31.01 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  28.17 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  29.58 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  29.93 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  27.27 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  29.93 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  28.47 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  31.76 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  29.05 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.08 
 
 		 476 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.05 
 
 		 487 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  27.27 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  29.66 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  27.78 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  28.77 
 
 		 472 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  25 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  28.77 
 
 		 472 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0141  porphyrin biosynthesis protein, putative  31.78 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  32.67 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2642  precorrin-2 dehydrogenase  30.77 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.77 
 
 		 472 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2697  precorrin-2 dehydrogenase  30.77 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  29.05 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  29.05 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  24.11 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  29.05 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  29.71 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  28.38 
 
 		 321 aa  77  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  26.17 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.08 
 
 		 493 aa  77  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  26.95 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  29.25 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2307  porphyrin biosynthesis protein, putative  29.46 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187642  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  29.46 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.61 
 
 		 502 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25 
 
 		 462 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  25 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  31.03 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.87 
 
 		 480 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  25.36 
 
 		 188 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0049  porphyrin biosynthesis protein, putative  30 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.843521 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.95 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  28.06 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  30.08 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.93 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  28.17 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  29.73 
 
 		 472 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  31.75 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  30.95 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  31.75 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  31.75 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  31.75 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  31.75 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  29.08 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  27.74 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  30.28 
 
 		 212 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  31.75 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  26.71 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.03 
 
 		 480 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.17 
 
 		 473 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.35 
 
 		 421 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.56 
 
 		 418 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  28.46 
 
 		 197 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.95 
 
 		 472 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  23.57 
 
 		 226 aa  70.5  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  25 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>