More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1721 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  100 
 
 		 573 aa  1163    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  34.38 
 
 		 578 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  34.73 
 
 		 578 aa  313  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  32.98 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  31.1 
 
 		 587 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  32.98 
 
 		 583 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 585 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  33.21 
 
 		 597 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  30.2 
 
 		 603 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  32.23 
 
 		 627 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  30.87 
 
 		 600 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 580 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  32.86 
 
 		 569 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  29.35 
 
 		 581 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  31.12 
 
 		 414 aa  134  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  37.61 
 
 		 506 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  30.14 
 
 		 594 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  29.69 
 
 		 567 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  28.43 
 
 		 612 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  28.77 
 
 		 488 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  27.48 
 
 		 617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  29.59 
 
 		 597 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  30.47 
 
 		 610 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  31.97 
 
 		 604 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  29.93 
 
 		 604 aa  127  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  30.21 
 
 		 599 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 576 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  27.91 
 
 		 600 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 483 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  29.37 
 
 		 564 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  31.2 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  25 
 
 		 623 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  28.09 
 
 		 633 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  33.48 
 
 		 600 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  29.92 
 
 		 574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  29.84 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  27.71 
 
 		 601 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  27.12 
 
 		 595 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  28.2 
 
 		 596 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  30.8 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  27.68 
 
 		 603 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  32.04 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 640 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  31.03 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.29 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  25.89 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  29.67 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  30.33 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  28.5 
 
 		 607 aa  107  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  28.98 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  31.19 
 
 		 400 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  27.34 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  30.54 
 
 		 568 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  32.16 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  30.2 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  27.94 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  28.18 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  32.16 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 495 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  27.19 
 
 		 389 aa  104  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  31.72 
 
 		 559 aa  103  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  29.84 
 
 		 577 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  30.62 
 
 		 465 aa  103  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  26.22 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 574 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  30.25 
 
 		 432 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 581 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  29.7 
 
 		 394 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  30.65 
 
 		 566 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.59 
 
 		 414 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  30.64 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  30.1 
 
 		 591 aa  100  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  28.91 
 
 		 576 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  29.56 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 581 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  27.48 
 
 		 1018 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  29.79 
 
 		 557 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.79 
 
 		 557 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  27.01 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 357 aa  97.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  27.36 
 
 		 394 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  27.62 
 
 		 576 aa  97.8  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 422 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 566 aa  97.4  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  28.57 
 
 		 589 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  28.57 
 
 		 589 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  28.57 
 
 		 589 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  28.51 
 
 		 557 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>