More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1493 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 124 aa  250  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  64.46 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  62.1 
 
 		 127 aa  157  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  63.33 
 
 		 126 aa  156  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  63.11 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  59.5 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  60.83 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  56.56 
 
 		 124 aa  146  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  60.16 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  57.6 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  57.6 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  57.6 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  58.87 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  60 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 		 125 aa  143  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 124 aa  143  9e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  52.42 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  54.84 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  56 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 123 aa  133  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  54.55 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  54.31 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 227 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  55.65 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  53.6 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  50.81 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  54.31 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  52.07 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  52.85 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  54.03 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  54.55 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  49.6 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  55.37 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>