More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0765 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  63.29 
 
 		 509 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  100 
 
 		 511 aa  1019    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  46.83 
 
 		 509 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  44.2 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  43.71 
 
 		 525 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.77 
 
 		 508 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  44.97 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.97 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 510 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 		 510 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 510 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  43.28 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 510 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 		 511 aa  412  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  42.72 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 508 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  42.72 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  43.33 
 
 		 510 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  43.94 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  44.58 
 
 		 510 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  42.55 
 
 		 527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  43.58 
 
 		 518 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.02 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  44.58 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  41.18 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  42.97 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  42.72 
 
 		 518 aa  402  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  41.65 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  42.55 
 
 		 517 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  43.26 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.23 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  41.91 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  44 
 
 		 510 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  42.41 
 
 		 533 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  40 
 
 		 521 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.51 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  40.2 
 
 		 551 aa  392  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  41.2 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  41.58 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  41.24 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 545 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 		 523 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  40.2 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  40.58 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  39.72 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  42.24 
 
 		 515 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 511 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  42.6 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  39.6 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  40.95 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  40.63 
 
 		 547 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  41.6 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0533  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  41.21 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2035  ABC transporter related  41.85 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.755376  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  40.8 
 
 		 604 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 507 aa  375  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  39.44 
 
 		 491 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  39.65 
 
 		 524 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  40.56 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5419  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  41.73 
 
 		 531 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210593  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  40.24 
 
 		 527 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 505 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 534 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.67 
 
 		 522 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0037  ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3655  ABC transporter related  41.9 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1244  ABC transporter related  42.2 
 
 		 533 aa  372  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.21787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  40.82 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  41.92 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  39.53 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 521 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  40.2 
 
 		 532 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  40.56 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  38.35 
 
 		 500 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  38.15 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  38.98 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.22 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3673  ABC transporter related  38.76 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2077  ABC transporter related  41.4 
 
 		 529 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0945208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.68 
 
 		 523 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  40.16 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  39.22 
 
 		 506 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3190  ABC transporter related  39.8 
 
 		 514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.974403  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3629  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 510 aa  362  6e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  38.82 
 
 		 514 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>