More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2369 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  704  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  65.07 
 
 
363 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  62.36 
 
 
376 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  60.73 
 
 
362 aa  424  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  56.72 
 
 
363 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  61.06 
 
 
356 aa  400  1e-110  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  56.19 
 
 
379 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  44.38 
 
 
359 aa  282  6e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  38.73 
 
 
398 aa  245  7e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  34.26 
 
 
373 aa  202  1e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  33.88 
 
 
369 aa  198  1e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  31.71 
 
 
389 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  31.96 
 
 
406 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  36.42 
 
 
353 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  35.49 
 
 
346 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  32.08 
 
 
365 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  31.44 
 
 
360 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  32.86 
 
 
352 aa  185  1e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  33.14 
 
 
352 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  33.24 
 
 
350 aa  183  4e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  33.24 
 
 
353 aa  183  4e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  33.24 
 
 
398 aa  183  5e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  32.32 
 
 
394 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  32.93 
 
 
354 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  32.68 
 
 
355 aa  180  3e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  38.52 
 
 
349 aa  180  3e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  32.29 
 
 
352 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  33.71 
 
 
353 aa  179  5e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  35.33 
 
 
362 aa  179  5e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  33.92 
 
 
384 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  35 
 
 
355 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  32.39 
 
 
371 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  48.31 
 
 
353 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  31.73 
 
 
361 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  32.62 
 
 
354 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  35.35 
 
 
352 aa  174  3e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  46.89 
 
 
352 aa  173  4e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  46.89 
 
 
352 aa  173  4e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  46.89 
 
 
352 aa  173  4e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  46.89 
 
 
352 aa  173  4e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  46.89 
 
 
352 aa  173  4e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  46.89 
 
 
352 aa  173  4e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  46.89 
 
 
374 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  32.65 
 
 
358 aa  172  8e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  32.18 
 
 
354 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  36.14 
 
 
361 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  32.96 
 
 
371 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  32.49 
 
 
356 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  32.38 
 
 
354 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  30.06 
 
 
351 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  31.9 
 
 
354 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  31.99 
 
 
387 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  28.45 
 
 
347 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  31.44 
 
 
356 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  32.61 
 
 
365 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  31.5 
 
 
354 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  30.14 
 
 
361 aa  165  1e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  30.16 
 
 
355 aa  164  1e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  30.22 
 
 
363 aa  165  1e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  41.71 
 
 
350 aa  163  5e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  33.04 
 
 
352 aa  162  8e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  41.9 
 
 
358 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  33.02 
 
 
353 aa  154  3e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  30.61 
 
 
365 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  40 
 
 
381 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  40 
 
 
352 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  27.09 
 
 
372 aa  152  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  27.93 
 
 
391 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  27.09 
 
 
352 aa  152  9e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  33.03 
 
 
361 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  31.73 
 
 
361 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  33.52 
 
 
359 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  30.75 
 
 
358 aa  148  1e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.50105e-05  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  30.36 
 
 
397 aa  147  2e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  29.79 
 
 
415 aa  147  2e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  30.4 
 
 
363 aa  137  3e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  28.25 
 
 
353 aa  134  2e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  29.06 
 
 
339 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  29.09 
 
 
362 aa  132  8e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  38.42 
 
 
339 aa  131  2e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  30.2 
 
 
392 aa  128  1e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.8 
 
 
359 aa  128  1e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  31.44 
 
 
399 aa  128  2e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  30.58 
 
 
385 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.66 
 
 
345 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  28.65 
 
 
391 aa  119  5e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 
423 aa  119  5e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 
355 aa  117  2e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 
346 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  28.07 
 
 
360 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  28.45 
 
 
373 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4193  hypothetical protein  26.61 
 
 
400 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.662681  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  26.61 
 
 
400 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  25.73 
 
 
400 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  27.67 
 
 
346 aa  110  4e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  28.81 
 
 
345 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  28.06 
 
 
370 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  28.35 
 
 
356 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  26.82 
 
 
344 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  28.99 
 
 
360 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>