More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2078 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
402 aa  826    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  67.92 
 
 
465 aa  555  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  66.42 
 
 
402 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0340  exodeoxyribonuclease VII large subunit  62.19 
 
 
402 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0321  exodeoxyribonuclease VII large subunit  63.71 
 
 
407 aa  481  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.568977  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.93 
 
 
403 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.31 
 
 
411 aa  467  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.65 
 
 
406 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.15 
 
 
423 aa  279  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.64 
 
 
398 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.62 
 
 
404 aa  276  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.85 
 
 
406 aa  272  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.24 
 
 
453 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.27 
 
 
475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.24 
 
 
414 aa  266  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.29 
 
 
476 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40 
 
 
405 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.68 
 
 
414 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.62 
 
 
453 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.56 
 
 
463 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.68 
 
 
414 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.59 
 
 
458 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.41 
 
 
458 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.6 
 
 
392 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.03 
 
 
475 aa  262  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.91 
 
 
407 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.46 
 
 
407 aa  262  8e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1536  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.4 
 
 
401 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0037923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.7 
 
 
463 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.84 
 
 
400 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.84 
 
 
400 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  45.4 
 
 
463 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1695  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.79 
 
 
536 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.71 
 
 
410 aa  259  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.39 
 
 
411 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40 
 
 
396 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.64 
 
 
537 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.27 
 
 
398 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.63 
 
 
401 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.15 
 
 
416 aa  256  4e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.44 
 
 
393 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.95 
 
 
407 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.76 
 
 
459 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.92 
 
 
536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.34 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1859  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.92 
 
 
538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.020819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4330  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.87 
 
 
548 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554584  normal  0.651535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.52 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4621  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.28 
 
 
541 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.46 
 
 
459 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.44 
 
 
446 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.28 
 
 
463 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.72 
 
 
448 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.88 
 
 
454 aa  251  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.22 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.82 
 
 
541 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.22 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.13 
 
 
452 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.22 
 
 
549 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.3 
 
 
403 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37 
 
 
452 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37 
 
 
452 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37 
 
 
452 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.1 
 
 
541 aa  249  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.96 
 
 
496 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  39.38 
 
 
405 aa  249  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.09 
 
 
445 aa  249  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.09 
 
 
445 aa  249  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.44 
 
 
422 aa  248  9e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.4 
 
 
452 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.4 
 
 
452 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.72 
 
 
469 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6068  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.25 
 
 
507 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0339601  normal  0.285374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.2 
 
 
477 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.77 
 
 
452 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  42.33 
 
 
452 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.77 
 
 
452 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.86 
 
 
454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0494  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.63 
 
 
519 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.9 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.43 
 
 
526 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.18 
 
 
451 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.05 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.55 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.16 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1845  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.26 
 
 
519 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.264563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.26 
 
 
519 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.5 
 
 
401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.08 
 
 
458 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.65 
 
 
519 aa  243  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.96 
 
 
419 aa  243  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.47 
 
 
445 aa  242  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.83026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1331  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.94 
 
 
462 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.701446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.62 
 
 
527 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl331  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.4 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.57 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0667  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.65 
 
 
566 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0605  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.32 
 
 
516 aa  240  4e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.96 
 
 
447 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.52 
 
 
465 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>