198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1955 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  50.17 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  47.68 
 
 		 299 aa  280  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.7 
 
 		 198 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.7 
 
 		 198 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.46 
 
 		 200 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  40 
 
 		 191 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.33 
 
 		 183 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  37.16 
 
 		 189 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  38.12 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  33.71 
 
 		 206 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  32.6 
 
 		 187 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  32.96 
 
 		 190 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  34.24 
 
 		 187 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  32.6 
 
 		 187 aa  106  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  33.16 
 
 		 188 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  33.7 
 
 		 187 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  31.84 
 
 		 187 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  32.4 
 
 		 186 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  31.28 
 
 		 184 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  34.41 
 
 		 192 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  32.62 
 
 		 188 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  32.62 
 
 		 188 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  33.33 
 
 		 189 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  30.73 
 
 		 188 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  33.52 
 
 		 186 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  34.08 
 
 		 187 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  31.69 
 
 		 187 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  32.47 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  31.11 
 
 		 183 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  34.05 
 
 		 190 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  32.4 
 
 		 186 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  35.33 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  32.24 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  31.84 
 
 		 191 aa  97.1  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  32.4 
 
 		 190 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  32.24 
 
 		 189 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  30.92 
 
 		 254 aa  95.9  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  32.24 
 
 		 186 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  31.69 
 
 		 188 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  30.57 
 
 		 195 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  34.91 
 
 		 186 aa  95.1  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  33.7 
 
 		 188 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  30.6 
 
 		 191 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  29.57 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  29.78 
 
 		 185 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  33.15 
 
 		 190 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  34.24 
 
 		 192 aa  94  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  33.15 
 
 		 190 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  31.32 
 
 		 186 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  30.17 
 
 		 188 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  30.93 
 
 		 195 aa  92.8  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  31.67 
 
 		 188 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  32.96 
 
 		 180 aa  91.3  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  31.61 
 
 		 186 aa  90.5  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  32.6 
 
 		 188 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  34.95 
 
 		 188 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  29.73 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  30.17 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  25.56 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.48 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.48 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  45.45 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.42 
 
 		 77 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  25.54 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.29 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.91 
 
 		 74 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.48 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.24 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  40.62 
 
 		 103 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.06 
 
 		 81 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  36.36 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.71 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  39.71 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.25 
 
 		 76 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.91 
 
 		 80 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.91 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.59 
 
 		 87 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  49.12 
 
 		 81 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  49.12 
 
 		 81 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  49.12 
 
 		 81 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  49.12 
 
 		 81 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.67 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.39 
 
 		 73 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  44.64 
 
 		 73 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  46.43 
 
 		 74 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 73 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.59 
 
 		 73 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  48.15 
 
 		 74 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  41.77 
 
 		 81 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  42.59 
 
 		 74 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.33 
 
 		 73 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  39.73 
 
 		 81 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.59 
 
 		 72 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.88 
 
 		 73 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.11 
 
 		 79 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.11 
 
 		 79 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  42.25 
 
 		 81 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  44.68 
 
 		 74 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>