More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1666 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  80.53 
 
 		 113 aa  192  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  73.45 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  60.36 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  59.05 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  54.46 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  61.32 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  54.95 
 
 		 124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  50.48 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  35.85 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  36.79 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  41.57 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  35.79 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  34.65 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  27.55 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>