More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0628 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  100 
 
 		 146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  79.31 
 
 		 146 aa  259  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  80 
 
 		 146 aa  253  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  76.92 
 
 		 153 aa  243  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  74.48 
 
 		 146 aa  242  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  73.97 
 
 		 146 aa  241  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0706  ribonuclease H  65.75 
 
 		 146 aa  202  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.572232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  67.91 
 
 		 152 aa  197  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  61.11 
 
 		 145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  60.42 
 
 		 147 aa  193  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  60.28 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  59.86 
 
 		 155 aa  187  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  58.62 
 
 		 152 aa  181  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  57.75 
 
 		 159 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  57.34 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  55.63 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  56.83 
 
 		 153 aa  166  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  53.9 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  53.9 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  54.61 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  54.61 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  51.39 
 
 		 155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  53.15 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  53.62 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  53.9 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  52.48 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  52.86 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  56.2 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  53.19 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  55.07 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  55.71 
 
 		 145 aa  157  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  51.05 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  50.72 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  51.05 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  54.29 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  52.17 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  51.77 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  50.71 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  51.45 
 
 		 154 aa  153  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  51.45 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  51.43 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  50.35 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  50.35 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  50.36 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  52.17 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  49.65 
 
 		 170 aa  152  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  52.78 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  52.55 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  50.72 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  52.14 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  51.11 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  50 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  50.7 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  50 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  52.52 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  52.52 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  50 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  50 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  50 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  50.71 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  50 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  50 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  52.14 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  52.14 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  50.72 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  53.57 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  50 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  48.55 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  48.57 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  47.68 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  50 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  51.06 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  48.57 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  48.57 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  48.57 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  53.28 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  52.55 
 
 		 159 aa  147  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  48.23 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  50.36 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  51.45 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  48.23 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  51.43 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  52.17 
 
 		 170 aa  146  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  48.57 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  48.57 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  47.52 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  48.95 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  47.89 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  48.57 
 
 		 241 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  48.61 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  49.3 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  50 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  47.59 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  47.14 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  48.2 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  49.28 
 
 		 163 aa  143  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  49.64 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  47.83 
 
 		 166 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  48.59 
 
 		 148 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>