249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1390 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  65.91 
 
 		 201 aa  237  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  65.91 
 
 		 201 aa  237  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  64.77 
 
 		 201 aa  234  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  46.32 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  34.54 
 
 		 212 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  34.54 
 
 		 212 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  38.86 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  36.53 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  37.81 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  35.03 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  36.14 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  33.91 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  34.24 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  38.55 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  35.2 
 
 		 210 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  35.63 
 
 		 209 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  33.74 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  36 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  36.55 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  32.98 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  31.84 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  39.22 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  36.87 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  38.42 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  37.85 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 		 219 aa  104  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  37.09 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  36.72 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  33.15 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  36.48 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  37.11 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 232 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  35.37 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  30.39 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  30.11 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  35.93 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  33.77 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  28.89 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  30.43 
 
 		 474 aa  95.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  28.57 
 
 		 216 aa  94.7  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  29.71 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  35.14 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  30.81 
 
 		 248 aa  84.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  35.64 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.59 
 
 		 646 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  28.5 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  33.91 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  27.66 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  32.5 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  28.25 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  34.24 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  27.45 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  27.91 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  27.91 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0245  dethiobiotin synthase  27.04 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.67584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  28.71 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  34.73 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  33.15 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  31.58 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0460  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  32.54 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  32.75 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  27.93 
 
 		 708 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  27.98 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  29.15 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  24.04 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  29.86 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  30.41 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  27.65 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  27.65 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  33.93 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  29.56 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  27.59 
 
 		 238 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  28.57 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  32.62 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  24.63 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  28.89 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  32.37 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  29.38 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  32.14 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  23.47 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  27.17 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  24.76 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  29.94 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  29.41 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  23.53 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  30.95 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  24.02 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  28.65 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  28.25 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  28.24 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  23.94 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  24.64 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  28.74 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  24.75 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  30.23 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  25.77 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  26.97 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>