More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1919 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  45.83 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  44.54 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  44.83 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  43.36 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  45.22 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  41.44 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  37.96 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  44.05 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  46.58 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  47.22 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  35.11 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  32.5 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  35 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  45.21 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  45.95 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  45.21 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  45.21 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  45.21 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  42.68 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  38.82 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 463 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  37.37 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.28 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  39.08 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  40.91 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  37.35 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 321 aa  57.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  40.28 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>