More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1129 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  100 
 
 
306 aa  631  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  85.29 
 
 
301 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  74.02 
 
 
298 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  61.37 
 
 
308 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  57.8 
 
 
304 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  56.34 
 
 
321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  54.61 
 
 
328 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  54.48 
 
 
303 aa  321  8e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  54.48 
 
 
303 aa  321  8e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  51.89 
 
 
298 aa  317  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  51.55 
 
 
298 aa  316  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  51.55 
 
 
298 aa  316  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  51.55 
 
 
298 aa  316  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  51.55 
 
 
298 aa  316  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  51.55 
 
 
298 aa  316  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  51.55 
 
 
298 aa  316  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  51.55 
 
 
298 aa  316  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  51.89 
 
 
298 aa  316  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  51.55 
 
 
298 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50.86 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  53.65 
 
 
294 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  53.19 
 
 
298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  50 
 
 
305 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  50 
 
 
305 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  49.65 
 
 
304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  52.48 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  50.18 
 
 
325 aa  301  9e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  50.18 
 
 
355 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  52.73 
 
 
297 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  50.87 
 
 
306 aa  298  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  51.09 
 
 
329 aa  298  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  49.64 
 
 
340 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  52.9 
 
 
314 aa  297  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  50.54 
 
 
321 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  50.36 
 
 
320 aa  296  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  51.64 
 
 
291 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  47.3 
 
 
321 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  49.64 
 
 
323 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  50.55 
 
 
292 aa  295  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  49.29 
 
 
327 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  49.29 
 
 
338 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  49.29 
 
 
338 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  50.91 
 
 
289 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  51.43 
 
 
324 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  49.29 
 
 
338 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  49.08 
 
 
287 aa  294  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  49.29 
 
 
335 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  51.26 
 
 
311 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  52 
 
 
294 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  50.18 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  48.93 
 
 
338 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  50.91 
 
 
289 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  47.7 
 
 
327 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  49.46 
 
 
321 aa  292  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  292  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  49.29 
 
 
320 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  53.87 
 
 
291 aa  291  9e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  47.54 
 
 
322 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  52.36 
 
 
294 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  49.28 
 
 
320 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  51.82 
 
 
320 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  49.65 
 
 
351 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  49.1 
 
 
282 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  50.73 
 
 
283 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  49.1 
 
 
321 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  49.82 
 
 
321 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  48.76 
 
 
309 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  49.82 
 
 
297 aa  290  3e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  47.7 
 
 
330 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  49.11 
 
 
337 aa  289  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  49.1 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  47.89 
 
 
321 aa  288  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  48.57 
 
 
318 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  49.1 
 
 
321 aa  288  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  47.7 
 
 
329 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  47.35 
 
 
330 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  47.7 
 
 
329 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.59 
 
 
318 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  47.35 
 
 
330 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  47.7 
 
 
329 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  47.5 
 
 
302 aa  288  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.99 
 
 
299 aa  288  1e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  51.96 
 
 
328 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  48.11 
 
 
348 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  47.7 
 
 
330 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>