131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0677 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
271 aa  565  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  85.24 
 
 
291 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  67.72 
 
 
673 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  64.39 
 
 
277 aa  346  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  40.85 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  40.33 
 
 
285 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40 
 
 
307 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.52 
 
 
273 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.21 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  41.18 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.39 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.12 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.84 
 
 
296 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.84 
 
 
296 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.79 
 
 
286 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  37.84 
 
 
296 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.1 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.74 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.9 
 
 
294 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.6 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  33.19 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  33.19 
 
 
253 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  35.75 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  33.91 
 
 
253 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35 
 
 
291 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.36 
 
 
530 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.14 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  31.05 
 
 
253 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.78 
 
 
284 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.78 
 
 
263 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.84 
 
 
284 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  31 
 
 
274 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  31.88 
 
 
263 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.47 
 
 
251 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  27.43 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.57 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  30.28 
 
 
323 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  30.28 
 
 
262 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.88 
 
 
263 aa  92  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.88 
 
 
263 aa  92  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  30.28 
 
 
262 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.13 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  30.59 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.95 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.73 
 
 
262 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  29.26 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.22 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  29.49 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.29 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  25.6 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.09 
 
 
348 aa  75.5  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.78 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.33 
 
 
704 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.06 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  28.63 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  29.7 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.69 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  36.27 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  28.63 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  29.06 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  29.06 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  24.43 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  31.33 
 
 
163 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.63 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  24.43 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  28.21 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  23.23 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  24.75 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  22.66 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  22.96 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.12 
 
 
279 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  22.84 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  29.63 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  41.79 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  23.64 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2942  retron adenine methylase  22.83 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0304018  hitchhiker  1.0655700000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  26.15 
 
 
277 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  27.27 
 
 
286 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  22.92 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  24.14 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  28.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.6 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.5 
 
 
293 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  28.03 
 
 
293 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  22.5 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  23.12 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  22.5 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  21.8 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  21.32 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  21.32 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  21.32 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  34.33 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  25.81 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  21.32 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  24.24 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  22.5 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  34.21 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  24.35 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  24.35 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  24.35 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>