74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0037 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
432 aa  870  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  55.22 
 
 
453 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.76 
 
 
500 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  58.09 
 
 
365 aa  326  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.62 
 
 
355 aa  60.8  4e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.82 
 
 
396 aa  59.7  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.82 
 
 
413 aa  59.3  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  32.52 
 
 
480 aa  57.4  5e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  4.6928e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.29 
 
 
370 aa  55.1  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.94 
 
 
405 aa  54.3  4e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.82 
 
 
374 aa  53.1  1e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.34 
 
 
262 aa  52.4  2e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.35 
 
 
398 aa  52  2e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  30.07 
 
 
283 aa  50.4  6e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  31.37 
 
 
374 aa  50.1  9e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  29.02 
 
 
242 aa  49.7  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  28.63 
 
 
242 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.54 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  27.67 
 
 
235 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  28.63 
 
 
242 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  27.49 
 
 
804 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  28.63 
 
 
242 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  30.77 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  29 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.91 
 
 
618 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  27.33 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  27.56 
 
 
242 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.31 
 
 
615 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.17 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.72 
 
 
497 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  28.09 
 
 
256 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  23.91 
 
 
879 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.68 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  26.98 
 
 
242 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  26.58 
 
 
237 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.06 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.18 
 
 
218 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  31.39 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  28.87 
 
 
249 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.92 
 
 
638 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  30.77 
 
 
256 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.45 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  31.31 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  26.48 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.13 
 
 
599 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  26.78 
 
 
242 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.85 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  28.85 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  26.48 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  28.57 
 
 
374 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  26.78 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  26.48 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.97 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.93 
 
 
378 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.48 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  27.06 
 
 
243 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.25 
 
 
361 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  39.13 
 
 
239 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  27 
 
 
490 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  30.77 
 
 
388 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.34 
 
 
455 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  40.98 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  31.65 
 
 
354 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.71 
 
 
597 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  27.17 
 
 
451 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  30.7 
 
 
459 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.75 
 
 
382 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  26.78 
 
 
242 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  26.89 
 
 
242 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.64 
 
 
369 aa  43.5  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.93 
 
 
375 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.1 
 
 
889 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.1 
 
 
506 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  34.18 
 
 
239 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>