More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0799 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  38.57 
 
 
1292 aa  770    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  69.32 
 
 
1202 aa  1727    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  70.09 
 
 
1221 aa  1758    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  65.32 
 
 
1212 aa  1609    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  37.5 
 
 
1345 aa  760    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  38.14 
 
 
1308 aa  768    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  36.89 
 
 
1342 aa  766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.51 
 
 
1309 aa  763    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  36.89 
 
 
1342 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.07 
 
 
1307 aa  786    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  37.69 
 
 
1291 aa  769    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  37.84 
 
 
1324 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  37.65 
 
 
1280 aa  822    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  36.89 
 
 
1342 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.16 
 
 
1259 aa  788    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.6 
 
 
1292 aa  734    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  36.89 
 
 
1342 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  38.28 
 
 
1292 aa  769    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  36.38 
 
 
1364 aa  770    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  75.35 
 
 
1217 aa  1872    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  100 
 
 
1214 aa  2494    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.33 
 
 
1304 aa  761    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  36.89 
 
 
1342 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  37.8 
 
 
1279 aa  784    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  37.06 
 
 
1359 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  80.31 
 
 
1210 aa  2014    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  36.86 
 
 
1342 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  65.08 
 
 
1213 aa  1604    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  37.27 
 
 
1345 aa  758    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.86 
 
 
1304 aa  776    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  65.16 
 
 
1212 aa  1605    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  37.55 
 
 
1307 aa  755    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  37.61 
 
 
1271 aa  787    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  37.14 
 
 
1300 aa  779    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  36.16 
 
 
1349 aa  772    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  76.5 
 
 
1218 aa  1915    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.67 
 
 
1265 aa  739    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  37.34 
 
 
1324 aa  777    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  37.99 
 
 
1307 aa  787    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.24 
 
 
1227 aa  1632    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  38.63 
 
 
1277 aa  790    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.71 
 
 
1279 aa  787    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.09 
 
 
1371 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.44 
 
 
1288 aa  786    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.68 
 
 
1289 aa  767    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  37.11 
 
 
1345 aa  756    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.35 
 
 
1218 aa  1880    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  36.89 
 
 
1342 aa  764    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  38.63 
 
 
1277 aa  790    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.4 
 
 
1282 aa  793    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  35.56 
 
 
1188 aa  592  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  33.59 
 
 
1183 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 
1183 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 
1204 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  33.56 
 
 
1197 aa  570  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 
1187 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.11 
 
 
1286 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.08 
 
 
1340 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.91 
 
 
1341 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.07 
 
 
1344 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  35.91 
 
 
1341 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.91 
 
 
1341 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  35.53 
 
 
1308 aa  393  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.69 
 
 
1340 aa  393  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  43.09 
 
 
1341 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.38 
 
 
460 aa  163  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.64 
 
 
459 aa  142  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  28.44 
 
 
459 aa  142  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  28.14 
 
 
459 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 
459 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.05 
 
 
485 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  27.34 
 
 
461 aa  131  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.97 
 
 
459 aa  131  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.75 
 
 
459 aa  131  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.37 
 
 
469 aa  131  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  27.64 
 
 
466 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  29.51 
 
 
499 aa  127  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.62 
 
 
481 aa  126  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  28.13 
 
 
499 aa  126  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  29.92 
 
 
499 aa  125  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.31 
 
 
500 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  28.91 
 
 
503 aa  125  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  29.02 
 
 
499 aa  125  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.53 
 
 
460 aa  122  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.3 
 
 
460 aa  122  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.3 
 
 
460 aa  122  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.88 
 
 
482 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.47 
 
 
493 aa  122  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 
472 aa  121  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.7 
 
 
457 aa  121  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  27.82 
 
 
456 aa  121  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  29.46 
 
 
499 aa  121  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  29.46 
 
 
499 aa  121  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.45 
 
 
501 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.88 
 
 
501 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  27.01 
 
 
483 aa  119  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  29.6 
 
 
499 aa  118  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  24.77 
 
 
430 aa  118  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  28.49 
 
 
499 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  28.49 
 
 
499 aa  117  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>