More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0427 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  56.2 
 
 
1277 aa  1434    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 
1210 aa  751    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  36.31 
 
 
1212 aa  752    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  68.7 
 
 
1308 aa  1815    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  86.69 
 
 
1345 aa  2391    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.26 
 
 
1289 aa  1533    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  82.06 
 
 
1342 aa  2263    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  82.06 
 
 
1342 aa  2263    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.36 
 
 
1340 aa  2238    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.72 
 
 
1279 aa  2048    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  82.13 
 
 
1342 aa  2267    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  82.06 
 
 
1342 aa  2263    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  86.1 
 
 
1345 aa  2371    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.09 
 
 
1286 aa  1441    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 
1221 aa  778    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  68.87 
 
 
1291 aa  1837    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  100 
 
 
1324 aa  2738    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  74.04 
 
 
1279 aa  2026    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  66.59 
 
 
1259 aa  1731    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  56.2 
 
 
1277 aa  1434    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  82.13 
 
 
1342 aa  2267    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  81.25 
 
 
1364 aa  2285    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  81.22 
 
 
1341 aa  2249    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  36.72 
 
 
1217 aa  763    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  38.15 
 
 
1214 aa  783    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  36.31 
 
 
1212 aa  754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  66.34 
 
 
1292 aa  1757    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.52 
 
 
1341 aa  2243    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  81.46 
 
 
1359 aa  2241    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  37.15 
 
 
1213 aa  775    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.4 
 
 
1307 aa  1860    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.12 
 
 
1304 aa  1925    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.95 
 
 
1265 aa  1878    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  69.12 
 
 
1307 aa  1889    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  65.43 
 
 
1271 aa  1740    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  71.74 
 
 
1300 aa  1946    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.65 
 
 
1309 aa  1972    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  81.76 
 
 
1349 aa  2277    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  37.06 
 
 
1218 aa  751    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  93.58 
 
 
1324 aa  2541    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  37.83 
 
 
1202 aa  791    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  86.02 
 
 
1345 aa  2370    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.13 
 
 
1304 aa  1880    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  82.06 
 
 
1342 aa  2263    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  81.52 
 
 
1341 aa  2243    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  69.4 
 
 
1307 aa  1859    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.2 
 
 
1371 aa  2250    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.13 
 
 
1292 aa  1818    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.33 
 
 
1288 aa  1547    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.48 
 
 
1218 aa  775    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  58.51 
 
 
1280 aa  1556    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  72.24 
 
 
1292 aa  1953    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.51 
 
 
1340 aa  2243    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.64 
 
 
1344 aa  2247    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.52 
 
 
1341 aa  2243    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  81.98 
 
 
1342 aa  2264    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.35 
 
 
1282 aa  1370    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  72.23 
 
 
1308 aa  1916    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  32.28 
 
 
1183 aa  520  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  31.47 
 
 
1188 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.62 
 
 
1187 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.65 
 
 
1227 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  34.27 
 
 
1197 aa  264  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  40.34 
 
 
1204 aa  262  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  35.9 
 
 
1183 aa  258  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  25.32 
 
 
430 aa  116  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.78 
 
 
411 aa  105  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.21 
 
 
469 aa  105  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  25.67 
 
 
456 aa  104  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.2 
 
 
460 aa  102  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.2 
 
 
460 aa  102  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.5 
 
 
459 aa  102  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.4 
 
 
460 aa  102  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.48 
 
 
459 aa  101  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  25.88 
 
 
472 aa  101  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  25.63 
 
 
472 aa  99.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.06 
 
 
460 aa  97.4  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.08 
 
 
423 aa  96.3  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.18 
 
 
429 aa  96.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.4 
 
 
461 aa  95.5  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.32 
 
 
413 aa  95.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  25.12 
 
 
461 aa  95.1  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  23.41 
 
 
421 aa  94.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  25.23 
 
 
457 aa  94.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.16 
 
 
485 aa  94.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  23.79 
 
 
423 aa  94.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1863  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.35 
 
 
430 aa  93.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.98 
 
 
434 aa  94  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.3 
 
 
418 aa  92.8  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.05 
 
 
413 aa  92.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  25.56 
 
 
473 aa  92.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.88 
 
 
475 aa  92  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.75 
 
 
485 aa  92  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  25.12 
 
 
473 aa  92  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  23.43 
 
 
423 aa  91.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  24.64 
 
 
473 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.64 
 
 
473 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  24 
 
 
413 aa  89.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  26.07 
 
 
473 aa  89.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  26.07 
 
 
473 aa  89.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>