More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1769 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.43 
 
 		 1344 aa  1430    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  59.19 
 
 		 1292 aa  1499    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  59.02 
 
 		 1308 aa  1486    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  56.04 
 
 		 1345 aa  1443    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.71 
 
 		 1304 aa  1400    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  56.34 
 
 		 1342 aa  1442    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  39.15 
 
 		 1218 aa  825    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.43 
 
 		 1289 aa  1654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  56.34 
 
 		 1342 aa  1442    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.48 
 
 		 1341 aa  1432    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  57.52 
 
 		 1291 aa  1476    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  63.3 
 
 		 1280 aa  1678    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  56.11 
 
 		 1324 aa  1457    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.78 
 
 		 1304 aa  1392    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  60.73 
 
 		 1259 aa  1555    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  39.59 
 
 		 1202 aa  844    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  56.34 
 
 		 1342 aa  1444    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1277 aa  2621    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  55.1 
 
 		 1341 aa  1425    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  39.1 
 
 		 1217 aa  803    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  38.67 
 
 		 1214 aa  815    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  57.04 
 
 		 1292 aa  1423    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.45 
 
 		 1340 aa  1432    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  100 
 
 		 1277 aa  2621    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  55.24 
 
 		 1307 aa  1384    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  56.34 
 
 		 1342 aa  1442    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  38.79 
 
 		 1212 aa  806    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  55.97 
 
 		 1359 aa  1431    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  38.47 
 
 		 1213 aa  804    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.24 
 
 		 1307 aa  1384    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  39.12 
 
 		 1221 aa  840    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  55.18 
 
 		 1307 aa  1384    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  38.79 
 
 		 1212 aa  804    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.34 
 
 		 1218 aa  818    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  60.54 
 
 		 1271 aa  1576    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.06 
 
 		 1286 aa  1554    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.61 
 
 		 1265 aa  1369    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  56.25 
 
 		 1300 aa  1429    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  56.42 
 
 		 1345 aa  1456    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  39.38 
 
 		 1210 aa  795    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  54.16 
 
 		 1349 aa  1427    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.74 
 
 		 1279 aa  1422    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  56.19 
 
 		 1342 aa  1440    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.9 
 
 		 1309 aa  1419    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  55.75 
 
 		 1324 aa  1452    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  54.38 
 
 		 1364 aa  1439    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  58.09 
 
 		 1308 aa  1416    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  56.34 
 
 		 1342 aa  1442    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  55.48 
 
 		 1341 aa  1432    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.25 
 
 		 1292 aa  1358    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.13 
 
 		 1288 aa  1615    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  55.55 
 
 		 1279 aa  1414    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.37 
 
 		 1340 aa  1427    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  56.34 
 
 		 1342 aa  1444    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  56.42 
 
 		 1345 aa  1456    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.48 
 
 		 1341 aa  1432    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.58 
 
 		 1371 aa  1411    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.98 
 
 		 1282 aa  1415    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  32.23 
 
 		 1188 aa  519  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.18 
 
 		 1187 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.72 
 
 		 1227 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  31.67 
 
 		 1183 aa  287  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  35.82 
 
 		 1197 aa  282  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  34.41 
 
 		 1204 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  29.24 
 
 		 1183 aa  258  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.21 
 
 		 456 aa  108  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  23.28 
 
 		 456 aa  107  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.68 
 
 		 456 aa  105  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  24.53 
 
 		 461 aa  104  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.16 
 
 		 495 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.94 
 
 		 434 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.41 
 
 		 495 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  27.85 
 
 		 987 aa  102  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 		 457 aa  100  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.99 
 
 		 423 aa  99.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  29.22 
 
 		 461 aa  99  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  29.22 
 
 		 461 aa  99  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.24 
 
 		 469 aa  99  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.94 
 
 		 459 aa  98.6  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.63 
 
 		 411 aa  97.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.87 
 
 		 459 aa  98.2  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.5 
 
 		 497 aa  97.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  32.28 
 
 		 497 aa  96.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  25.12 
 
 		 459 aa  95.1  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.6 
 
 		 501 aa  94.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  23.06 
 
 		 489 aa  94.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  25.12 
 
 		 459 aa  94.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  23.85 
 
 		 423 aa  94.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  28.95 
 
 		 497 aa  94.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.58 
 
 		 492 aa  94.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 497 aa  94.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0331  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.76 
 
 		 497 aa  93.6  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2414  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.76 
 
 		 497 aa  93.6  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3330  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  34.76 
 
 		 497 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3342  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.76 
 
 		 497 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3296  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  34.76 
 
 		 497 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2601  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.76 
 
 		 497 aa  93.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.97 
 
 		 494 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.73 
 
 		 457 aa  93.2  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1291  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.76 
 
 		 497 aa  93.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>