More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1789 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1183 aa  2446    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  59.21 
 
 		 1197 aa  1402    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  54.88 
 
 		 1188 aa  1354    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.58 
 
 		 1187 aa  1331    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  53.45 
 
 		 1204 aa  1313    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  50.13 
 
 		 1183 aa  1200    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  35.18 
 
 		 1221 aa  617  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  33.45 
 
 		 1202 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  34.23 
 
 		 1210 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 		 1218 aa  593  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  34.62 
 
 		 1217 aa  591  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  33.7 
 
 		 1214 aa  587  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  34.3 
 
 		 1213 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.14 
 
 		 1218 aa  582  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  34.49 
 
 		 1212 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  34.31 
 
 		 1212 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.27 
 
 		 1227 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  32.65 
 
 		 1259 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  30.29 
 
 		 1271 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  30.92 
 
 		 1349 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 		 1364 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1291 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  32.56 
 
 		 1292 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  32.4 
 
 		 1307 aa  521  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1324 aa  522  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  31.1 
 
 		 1342 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.24 
 
 		 1304 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  31.1 
 
 		 1342 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.07 
 
 		 1279 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.24 
 
 		 1309 aa  522  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  31.1 
 
 		 1342 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  31.1 
 
 		 1342 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  31.1 
 
 		 1342 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  31.26 
 
 		 1359 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  31.1 
 
 		 1342 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.14 
 
 		 1307 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  31.1 
 
 		 1342 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  31.86 
 
 		 1324 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 1289 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  33.88 
 
 		 1279 aa  519  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  30.62 
 
 		 1308 aa  515  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.85 
 
 		 1304 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  32.2 
 
 		 1300 aa  515  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.94 
 
 		 1340 aa  516  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.79 
 
 		 1340 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.36 
 
 		 1371 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  31.71 
 
 		 1308 aa  509  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.74 
 
 		 1265 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  31.81 
 
 		 1345 aa  499  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  30.61 
 
 		 1292 aa  499  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  30.87 
 
 		 1307 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  31.48 
 
 		 1345 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  31.56 
 
 		 1345 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 		 1341 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 		 1341 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 		 1292 aa  486  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  31.12 
 
 		 1341 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1341 aa  482  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 		 1344 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  31.95 
 
 		 1280 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.91 
 
 		 1286 aa  291  7e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.45 
 
 		 1277 aa  287  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  31.45 
 
 		 1277 aa  287  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 1288 aa  287  9e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.79 
 
 		 1282 aa  282  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  30.45 
 
 		 466 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  29.52 
 
 		 459 aa  159  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.95 
 
 		 459 aa  157  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  30.49 
 
 		 459 aa  157  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  30.49 
 
 		 459 aa  156  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.75 
 
 		 485 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 		 470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  27.86 
 
 		 490 aa  145  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.54 
 
 		 500 aa  142  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 475 aa  141  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  30.47 
 
 		 457 aa  141  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  29.51 
 
 		 461 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.15 
 
 		 459 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  29.24 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  27.97 
 
 		 461 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  27.67 
 
 		 483 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.21 
 
 		 470 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  29.38 
 
 		 499 aa  138  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.07 
 
 		 496 aa  138  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.65 
 
 		 494 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  26.76 
 
 		 499 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  30.09 
 
 		 457 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.17 
 
 		 501 aa  137  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  27.9 
 
 		 499 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.87 
 
 		 486 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.91 
 
 		 481 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  27.7 
 
 		 472 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  25.49 
 
 		 492 aa  135  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.55 
 
 		 490 aa  135  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.61 
 
 		 459 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.81 
 
 		 469 aa  134  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.53 
 
 		 470 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.53 
 
 		 470 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.53 
 
 		 470 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  28.4 
 
 		 499 aa  134  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>