More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0219 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  64.34 
 
 		 1364 aa  1703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  60.42 
 
 		 1277 aa  1528    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  65.12 
 
 		 1308 aa  1659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  65.57 
 
 		 1345 aa  1712    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.61 
 
 		 1289 aa  1659    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.33 
 
 		 1304 aa  1651    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  38.36 
 
 		 1221 aa  793    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.66 
 
 		 1341 aa  1718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.03 
 
 		 1307 aa  1623    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  60.42 
 
 		 1277 aa  1528    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  66.39 
 
 		 1342 aa  1737    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  38.96 
 
 		 1212 aa  770    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.75 
 
 		 1227 aa  780    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.79 
 
 		 1309 aa  1680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  65.27 
 
 		 1291 aa  1700    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  66.59 
 
 		 1324 aa  1733    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  38.65 
 
 		 1210 aa  790    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.81 
 
 		 1286 aa  1508    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  100 
 
 		 1259 aa  2591    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  66.39 
 
 		 1342 aa  1737    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  66.39 
 
 		 1342 aa  1739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  66.39 
 
 		 1342 aa  1739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  66.39 
 
 		 1342 aa  1736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  65.28 
 
 		 1341 aa  1714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  38.22 
 
 		 1217 aa  775    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  39.11 
 
 		 1214 aa  786    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  66.18 
 
 		 1292 aa  1697    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  66 
 
 		 1308 aa  1664    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  39.41 
 
 		 1202 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  65.34 
 
 		 1345 aa  1699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  65.27 
 
 		 1345 aa  1696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.23 
 
 		 1304 aa  1652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  65.79 
 
 		 1359 aa  1719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  62.39 
 
 		 1280 aa  1637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  39.52 
 
 		 1213 aa  785    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  66.39 
 
 		 1342 aa  1737    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  63.59 
 
 		 1307 aa  1654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  70.23 
 
 		 1271 aa  1855    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  64.65 
 
 		 1300 aa  1670    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.04 
 
 		 1344 aa  1730    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.06 
 
 		 1265 aa  1614    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  38.42 
 
 		 1218 aa  785    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  64.57 
 
 		 1349 aa  1711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  66.39 
 
 		 1342 aa  1737    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.52 
 
 		 1279 aa  1640    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  66.21 
 
 		 1324 aa  1734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  62.95 
 
 		 1307 aa  1620    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.72 
 
 		 1292 aa  1598    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  62.74 
 
 		 1279 aa  1615    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  65.66 
 
 		 1341 aa  1718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  65.63 
 
 		 1292 aa  1681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.54 
 
 		 1288 aa  1602    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.86 
 
 		 1340 aa  1724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.71 
 
 		 1340 aa  1720    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  38.96 
 
 		 1212 aa  770    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.5 
 
 		 1218 aa  791    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.66 
 
 		 1341 aa  1718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.09 
 
 		 1282 aa  1394    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.35 
 
 		 1371 aa  1702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  32.65 
 
 		 1183 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  33.36 
 
 		 1188 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  31.75 
 
 		 1183 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.91 
 
 		 1187 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  32.95 
 
 		 1204 aa  502  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  31.8 
 
 		 1197 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  24.68 
 
 		 430 aa  116  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.29 
 
 		 418 aa  106  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.75 
 
 		 459 aa  103  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.19 
 
 		 459 aa  103  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  26.74 
 
 		 461 aa  99.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  24.26 
 
 		 456 aa  99.4  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.89 
 
 		 411 aa  98.2  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.18 
 
 		 434 aa  97.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.33 
 
 		 460 aa  96.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.85 
 
 		 423 aa  97.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.56 
 
 		 460 aa  95.1  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.56 
 
 		 460 aa  95.1  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.27 
 
 		 413 aa  94.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  23.56 
 
 		 952 aa  94.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.81 
 
 		 460 aa  94  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.37 
 
 		 413 aa  93.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  25.51 
 
 		 472 aa  93.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  23.49 
 
 		 461 aa  92  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  24.74 
 
 		 413 aa  92  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  27.29 
 
 		 459 aa  91.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  23.11 
 
 		 423 aa  91.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  24.08 
 
 		 421 aa  90.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  27.06 
 
 		 459 aa  90.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  25.9 
 
 		 457 aa  90.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  24.41 
 
 		 492 aa  89.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  25.95 
 
 		 472 aa  89.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  24.56 
 
 		 421 aa  89.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.3 
 
 		 459 aa  89  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  26.23 
 
 		 460 aa  89  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.64 
 
 		 475 aa  88.2  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.74 
 
 		 495 aa  88.2  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.74 
 
 		 495 aa  88.2  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  25.62 
 
 		 987 aa  87.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.47 
 
 		 459 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  24.87 
 
 		 489 aa  87.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>