More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1263 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.24 
 
 		 1279 aa  813    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  37.98 
 
 		 1308 aa  751    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  36.95 
 
 		 1345 aa  761    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1202 aa  2476    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  37.1 
 
 		 1345 aa  763    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  36.39 
 
 		 1364 aa  784    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.28 
 
 		 1304 aa  774    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 		 1341 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  37 
 
 		 1342 aa  770    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  38.22 
 
 		 1280 aa  840    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.6 
 
 		 1227 aa  1604    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.05 
 
 		 1218 aa  1721    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  37.16 
 
 		 1342 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.57 
 
 		 1371 aa  761    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1291 aa  780    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1324 aa  792    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.29 
 
 		 1292 aa  730    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  37 
 
 		 1342 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  37 
 
 		 1342 aa  771    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.41 
 
 		 1259 aa  829    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.13 
 
 		 1282 aa  780    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  37 
 
 		 1342 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 		 1341 aa  773    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.69 
 
 		 1265 aa  742    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  36.75 
 
 		 1341 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  64.32 
 
 		 1212 aa  1611    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  69.19 
 
 		 1217 aa  1707    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  69.32 
 
 		 1214 aa  1727    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  37.15 
 
 		 1307 aa  769    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.27 
 
 		 1289 aa  791    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  37.14 
 
 		 1359 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  38.38 
 
 		 1308 aa  764    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.22 
 
 		 1307 aa  767    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  63.93 
 
 		 1213 aa  1594    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  37 
 
 		 1342 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  38.24 
 
 		 1292 aa  769    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.03 
 
 		 1286 aa  818    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  37.25 
 
 		 1307 aa  747    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  37.66 
 
 		 1271 aa  809    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  38.37 
 
 		 1300 aa  776    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  64.23 
 
 		 1212 aa  1610    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  39.33 
 
 		 1277 aa  833    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  36.83 
 
 		 1349 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.94 
 
 		 1309 aa  763    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  37.79 
 
 		 1324 aa  790    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  37.87 
 
 		 1292 aa  783    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 		 1304 aa  768    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  74.29 
 
 		 1221 aa  1861    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  38.14 
 
 		 1279 aa  800    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  37.17 
 
 		 1345 aa  761    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  70.36 
 
 		 1210 aa  1755    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  37.39 
 
 		 1341 aa  773    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  37 
 
 		 1342 aa  770    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  39.33 
 
 		 1277 aa  833    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.16 
 
 		 1344 aa  767    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.93 
 
 		 1288 aa  812    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.45 
 
 		 1340 aa  777    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.18 
 
 		 1340 aa  777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  69.36 
 
 		 1218 aa  1726    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  33.78 
 
 		 1188 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  33.45 
 
 		 1183 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 		 1183 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  33.14 
 
 		 1197 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  33.55 
 
 		 1204 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.6 
 
 		 1187 aa  579  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  27.71 
 
 		 459 aa  145  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  28.23 
 
 		 459 aa  145  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  27.71 
 
 		 459 aa  144  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.06 
 
 		 459 aa  142  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  28.43 
 
 		 466 aa  140  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.04 
 
 		 485 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.73 
 
 		 500 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  29.18 
 
 		 464 aa  126  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.1 
 
 		 460 aa  123  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  25.18 
 
 		 472 aa  124  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.97 
 
 		 459 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.75 
 
 		 457 aa  122  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  26.25 
 
 		 461 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  26.67 
 
 		 481 aa  121  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.32 
 
 		 469 aa  121  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.06 
 
 		 461 aa  119  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.81 
 
 		 459 aa  119  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.7 
 
 		 459 aa  119  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.91 
 
 		 482 aa  119  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.58 
 
 		 456 aa  118  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  27.32 
 
 		 497 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  25.54 
 
 		 462 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.29 
 
 		 460 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.46 
 
 		 493 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.78 
 
 		 493 aa  117  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  27.83 
 
 		 503 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.82 
 
 		 460 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 		 464 aa  117  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.82 
 
 		 460 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  25.54 
 
 		 457 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.79 
 
 		 481 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 		 461 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  25.83 
 
 		 483 aa  116  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  25.42 
 
 		 485 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  26.25 
 
 		 461 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>