More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0306 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  76.5 
 
 		 1204 aa  1915    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  72.32 
 
 		 1188 aa  1796    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  54.58 
 
 		 1183 aa  1349    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 1187 aa  2440    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  63.92 
 
 		 1183 aa  1576    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  54.36 
 
 		 1197 aa  1280    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  35.17 
 
 		 1221 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 1218 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  35.93 
 
 		 1217 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 		 1210 aa  601  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  34.6 
 
 		 1202 aa  588  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  35.26 
 
 		 1212 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  35.31 
 
 		 1218 aa  586  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  35.01 
 
 		 1213 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  35.23 
 
 		 1212 aa  582  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  33.61 
 
 		 1214 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.47 
 
 		 1227 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 		 1289 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  30.38 
 
 		 1280 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  31.87 
 
 		 1271 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  31.91 
 
 		 1259 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.46 
 
 		 1304 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  32.48 
 
 		 1292 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  32.09 
 
 		 1277 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.09 
 
 		 1277 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  31.09 
 
 		 1300 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.6 
 
 		 1307 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  32.69 
 
 		 1307 aa  502  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.56 
 
 		 1304 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 		 1292 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  32.14 
 
 		 1307 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.64 
 
 		 1279 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.27 
 
 		 1309 aa  493  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.66 
 
 		 1265 aa  488  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1291 aa  483  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  32.84 
 
 		 1279 aa  483  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  32.97 
 
 		 1308 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.3 
 
 		 1292 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  30.91 
 
 		 1308 aa  452  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.24 
 
 		 1371 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.9 
 
 		 1282 aa  294  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.38 
 
 		 1288 aa  293  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  31.74 
 
 		 1324 aa  283  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.16 
 
 		 1286 aa  279  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 1341 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  31.29 
 
 		 1341 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 1341 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 		 1340 aa  274  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  31.75 
 
 		 1342 aa  274  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  31.41 
 
 		 1342 aa  274  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.64 
 
 		 1344 aa  274  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  31.41 
 
 		 1342 aa  274  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  31.75 
 
 		 1342 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  31.75 
 
 		 1342 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  31.75 
 
 		 1342 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  31.75 
 
 		 1342 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1341 aa  271  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.79 
 
 		 1340 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1324 aa  268  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  31.48 
 
 		 1364 aa  267  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  31.36 
 
 		 1359 aa  265  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  30.45 
 
 		 1349 aa  262  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 		 1345 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 		 1345 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  29.52 
 
 		 1345 aa  252  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  31.77 
 
 		 466 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  30.89 
 
 		 459 aa  163  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  30.83 
 
 		 459 aa  158  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  30.81 
 
 		 461 aa  157  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  31.63 
 
 		 459 aa  155  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  31.39 
 
 		 459 aa  154  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.1 
 
 		 459 aa  142  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  26.8 
 
 		 483 aa  142  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.41 
 
 		 459 aa  139  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.31 
 
 		 460 aa  138  8e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.37 
 
 		 481 aa  134  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  28.64 
 
 		 497 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  27.36 
 
 		 461 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  27.96 
 
 		 497 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28 
 
 		 497 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.24 
 
 		 464 aa  131  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.81 
 
 		 485 aa  131  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 		 457 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  28.4 
 
 		 497 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.5 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.89 
 
 		 469 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  26.35 
 
 		 481 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  26.75 
 
 		 490 aa  130  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 		 497 aa  129  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.54 
 
 		 482 aa  129  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.32 
 
 		 459 aa  129  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.29 
 
 		 459 aa  129  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 		 475 aa  127  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.67 
 
 		 497 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  27.94 
 
 		 472 aa  127  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2414  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.58 
 
 		 497 aa  126  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  25.73 
 
 		 492 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3296  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.58 
 
 		 497 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3330  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.58 
 
 		 497 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.29 
 
 		 501 aa  127  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>