More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0312 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  100 
 
 		 1188 aa  2465    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.32 
 
 		 1187 aa  1775    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  54.33 
 
 		 1197 aa  1291    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  68.61 
 
 		 1204 aa  1733    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  60.22 
 
 		 1183 aa  1474    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  54.88 
 
 		 1183 aa  1354    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  35.78 
 
 		 1210 aa  627  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  34.42 
 
 		 1221 aa  618  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  33.78 
 
 		 1202 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.67 
 
 		 1218 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  34 
 
 		 1218 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  36.31 
 
 		 1212 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  34.53 
 
 		 1217 aa  596  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  35.98 
 
 		 1213 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  36.13 
 
 		 1212 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  35.56 
 
 		 1214 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.7 
 
 		 1227 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  33.36 
 
 		 1259 aa  538  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.39 
 
 		 1289 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.82 
 
 		 1277 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  31.82 
 
 		 1277 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  32.03 
 
 		 1271 aa  513  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  32.63 
 
 		 1292 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.59 
 
 		 1304 aa  513  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  31.84 
 
 		 1292 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1291 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 		 1286 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.29 
 
 		 1307 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 		 1304 aa  499  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  31.95 
 
 		 1307 aa  498  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  30.2 
 
 		 1300 aa  499  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  32.08 
 
 		 1308 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 		 1309 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  31.32 
 
 		 1307 aa  492  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.17 
 
 		 1279 aa  492  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  30.28 
 
 		 1279 aa  489  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  32.17 
 
 		 1308 aa  483  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  30.21 
 
 		 1342 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  30.21 
 
 		 1342 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  30.29 
 
 		 1342 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 1265 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  30.13 
 
 		 1342 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  30.13 
 
 		 1342 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  30.13 
 
 		 1342 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  30.13 
 
 		 1342 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 1292 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.06 
 
 		 1282 aa  294  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  39 
 
 		 1280 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.93 
 
 		 1288 aa  281  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  31.2 
 
 		 1324 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  36.15 
 
 		 1349 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  29.33 
 
 		 1359 aa  258  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  36.83 
 
 		 1364 aa  258  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1324 aa  257  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.77 
 
 		 1340 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.11 
 
 		 1340 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.96 
 
 		 1371 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 		 1341 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.86 
 
 		 1344 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  29.28 
 
 		 1341 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 		 1341 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1341 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  30.25 
 
 		 1345 aa  250  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  29.28 
 
 		 1345 aa  250  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 		 1345 aa  250  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  29.37 
 
 		 459 aa  168  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  29.85 
 
 		 459 aa  166  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  29.56 
 
 		 466 aa  163  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 		 459 aa  154  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  29.1 
 
 		 459 aa  154  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  28.61 
 
 		 461 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.75 
 
 		 459 aa  148  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 459 aa  147  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.32 
 
 		 470 aa  142  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.71 
 
 		 469 aa  137  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  25.88 
 
 		 483 aa  135  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.29 
 
 		 460 aa  135  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  26.05 
 
 		 461 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.22 
 
 		 459 aa  132  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.51 
 
 		 464 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.22 
 
 		 482 aa  131  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.8 
 
 		 475 aa  131  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  25.67 
 
 		 474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.43 
 
 		 459 aa  129  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  25.41 
 
 		 490 aa  129  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  26.29 
 
 		 472 aa  129  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  28.29 
 
 		 464 aa  128  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  28.19 
 
 		 481 aa  127  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 		 457 aa  127  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.86 
 
 		 468 aa  126  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.72 
 
 		 485 aa  126  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.22 
 
 		 485 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.25 
 
 		 486 aa  125  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 462 aa  125  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.05 
 
 		 486 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  27.27 
 
 		 477 aa  125  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.48 
 
 		 479 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  28.24 
 
 		 456 aa  124  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.76 
 
 		 464 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.55 
 
 		 494 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>