57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0098 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  43.43 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  41.24 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  39.29 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  43.3 
 
 		 196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  34.39 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  32.73 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  33.33 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  28.19 
 
 		 237 aa  89  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  28.19 
 
 		 267 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  28.88 
 
 		 336 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  28.88 
 
 		 336 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  29.83 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  26.98 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  26.32 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  27.84 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  28.93 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  28.57 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  30.37 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  26.63 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  26.63 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  26.63 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  26.63 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  26.63 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  29.52 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  25.93 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  26.63 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  28.92 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  26.63 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  26.63 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  28.92 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  26.63 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  28.31 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  26.92 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5511  yecA family protein  25.43 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6093  yecA family protein  25.43 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6363  yecA family protein  25.43 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1225  yecA family protein  25.43 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00521886  normal  0.0870592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  23.53 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4329  yecA family protein  24.28 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  23.12 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2745  yecA family protein  23.7 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  23.81 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  22.46 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  28.65 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  25.91 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  25.91 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  27.52 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  24.66 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  27.4 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  25.93 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  24.56 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  25.97 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0305  yecA family protein  30.93 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0788  yecA family protein  26.87 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  26.15 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  22.56 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>