More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0049 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.19 
 
 
680 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  59.82 
 
 
673 aa  816    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  100 
 
 
663 aa  1364    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  65.81 
 
 
680 aa  894    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.73 
 
 
673 aa  862    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  62.44 
 
 
684 aa  855    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.05 
 
 
670 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.8 
 
 
657 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 
654 aa  323  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.96 
 
 
660 aa  319  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.2 
 
 
657 aa  308  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  32.59 
 
 
713 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 
657 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.04 
 
 
662 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
689 aa  300  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  32.77 
 
 
708 aa  295  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  32.09 
 
 
711 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 
657 aa  289  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  30.45 
 
 
656 aa  287  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 
705 aa  281  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.34 
 
 
695 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 
729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.27 
 
 
682 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 
672 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  32.1 
 
 
740 aa  275  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  32.37 
 
 
708 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  30.04 
 
 
723 aa  269  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  30.58 
 
 
644 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  28.99 
 
 
719 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 
586 aa  261  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 
675 aa  260  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  30.23 
 
 
734 aa  259  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 
675 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  30.58 
 
 
646 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
675 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 
582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 
649 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.13 
 
 
645 aa  251  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 
671 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 
578 aa  250  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 
553 aa  250  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 
656 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06545  penicillin-binding protein  31.49 
 
 
662 aa  249  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0208895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.51 
 
 
578 aa  247  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  30.85 
 
 
583 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1805  peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 
669 aa  246  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
690 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.65 
 
 
704 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 
578 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 
578 aa  243  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  29.7 
 
 
638 aa  243  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 
587 aa  242  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.62 
 
 
703 aa  242  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 
583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 
638 aa  241  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
582 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 
582 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  31.1 
 
 
622 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 
839 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  28.38 
 
 
645 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1254  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
562 aa  238  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  28.85 
 
 
638 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
571 aa  237  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 
631 aa  237  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  28.7 
 
 
638 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  28.7 
 
 
638 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  28.7 
 
 
638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 
570 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  28.99 
 
 
638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  28.55 
 
 
638 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 
736 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.77 
 
 
708 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  31.26 
 
 
595 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
654 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.1 
 
 
579 aa  234  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  31.83 
 
 
615 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 
653 aa  234  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 
578 aa  234  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  28.55 
 
 
638 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 
595 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  28.7 
 
 
638 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  30.97 
 
 
614 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  28.98 
 
 
728 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
615 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 
614 aa  233  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  27.98 
 
 
727 aa  233  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  28.55 
 
 
638 aa  233  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
615 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  28.98 
 
 
721 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 
615 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
615 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  28.55 
 
 
638 aa  233  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  30.26 
 
 
580 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  27.91 
 
 
727 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 
616 aa  232  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.24 
 
 
710 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.67 
 
 
644 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  30.97 
 
 
614 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  30.97 
 
 
614 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>