More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5275 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  66.6 
 
 
505 aa  642  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  100 
 
 
508 aa  989  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  65.26 
 
 
500 aa  624  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  64.49 
 
 
498 aa  601  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  60.76 
 
 
510 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  61.28 
 
 
511 aa  584  1e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  61.91 
 
 
516 aa  582  1e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  61 
 
 
516 aa  573  1e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  60.69 
 
 
509 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  60.69 
 
 
499 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  52.53 
 
 
505 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  51.43 
 
 
861 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  53.89 
 
 
508 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  52.44 
 
 
504 aa  475  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  51.3 
 
 
501 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  47.31 
 
 
510 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  46.81 
 
 
524 aa  465  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  46.81 
 
 
524 aa  465  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.66 
 
 
503 aa  467  1e-130  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.10391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  47 
 
 
525 aa  467  1e-130  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  46.99 
 
 
524 aa  467  1e-130  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 
527 aa  466  1e-130  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  51.83 
 
 
519 aa  468  1e-130  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.14 
 
 
497 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  46.99 
 
 
524 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  45.07 
 
 
512 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 
525 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  47.38 
 
 
518 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  46.65 
 
 
524 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.77 
 
 
511 aa  458  1e-128  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  49.3 
 
 
512 aa  461  1e-128  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  46.76 
 
 
524 aa  460  1e-128  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  50.51 
 
 
495 aa  460  1e-128  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  46.22 
 
 
503 aa  460  1e-128  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 
494 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  47.56 
 
 
516 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  46.22 
 
 
513 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  46.32 
 
 
517 aa  452  1e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.07 
 
 
496 aa  455  1e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
515 aa  453  1e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.76 
 
 
501 aa  453  1e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  47.27 
 
 
521 aa  452  1e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  47.66 
 
 
503 aa  452  1e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.96 
 
 
501 aa  452  1e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  48.88 
 
 
522 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  42.63 
 
 
501 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  45.12 
 
 
513 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  43.71 
 
 
511 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  45.33 
 
 
513 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  50.5 
 
 
499 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.56 
 
 
501 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.63 
 
 
501 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  46.25 
 
 
495 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  46.09 
 
 
524 aa  446  1e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  46.03 
 
 
516 aa  445  1e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.12 
 
 
492 aa  446  1e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  48.17 
 
 
520 aa  447  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 
507 aa  446  1e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  46.84 
 
 
537 aa  445  1e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  44.83 
 
 
500 aa  446  1e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  47.39 
 
 
508 aa  447  1e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  47.24 
 
 
512 aa  448  1e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  48.21 
 
 
513 aa  446  1e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 
523 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  47.09 
 
 
512 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  44.15 
 
 
501 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  46.34 
 
 
507 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  43.79 
 
 
501 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  46.87 
 
 
513 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  47.09 
 
 
512 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  43.79 
 
 
501 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.79 
 
 
501 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  48.27 
 
 
515 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  47.11 
 
 
514 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  46.34 
 
 
507 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  44.81 
 
 
500 aa  440  1e-122  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  42.94 
 
 
494 aa  441  1e-122  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.1797e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  43.58 
 
 
501 aa  439  1e-122  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  43.64 
 
 
516 aa  439  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  43.79 
 
 
501 aa  439  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  43.64 
 
 
516 aa  439  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  43.64 
 
 
516 aa  439  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  43.79 
 
 
501 aa  440  1e-122  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  43.64 
 
 
516 aa  439  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  43.79 
 
 
501 aa  441  1e-122  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.35 
 
 
501 aa  440  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  9.93507e-07 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  41.75 
 
 
501 aa  439  1e-122  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.28 
 
 
501 aa  439  1e-122  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  46.46 
 
 
511 aa  440  1e-122  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.4 
 
 
499 aa  441  1e-122  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  47.9 
 
 
517 aa  441  1e-122  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  43.79 
 
 
501 aa  441  1e-122  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  47.27 
 
 
507 aa  439  1e-122  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 
512 aa  441  1e-122  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  49.6 
 
 
519 aa  440  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
492 aa  441  1e-122  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.4 
 
 
499 aa  441  1e-122  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.79 
 
 
501 aa  441  1e-122  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  45.86 
 
 
511 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  44.51 
 
 
496 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>