More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3148 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  100 
 
 		 133 aa  272  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  38.4 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  40.18 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  34.88 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  30.47 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  49.32 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  49.28 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  49.32 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  31.65 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  35.2 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.36 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  47.95 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  47.95 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.8 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  42.55 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  42.55 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  36.79 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  47.95 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  31.73 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  40.34 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  47.95 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  26.72 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30.89 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.96 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  33.96 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  36.27 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  37.89 
 
 		 455 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 189 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.65 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  35.24 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  33.96 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.04 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.98 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  39.19 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  35.85 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  41.43 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  31.01 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  30.95 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.42 
 
 		 186 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  35.85 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  48.48 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 		 389 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  25.44 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 470 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  45.12 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.74 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  32.41 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.74 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  32 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.84 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.19 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.21 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  37.65 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  46.91 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>