232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2074 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  100 
 
 
433 aa  889    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  54.97 
 
 
429 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  52.93 
 
 
445 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  50.71 
 
 
461 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  48.83 
 
 
486 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  49.53 
 
 
434 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  48.22 
 
 
447 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  46.21 
 
 
436 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  47.09 
 
 
482 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  42.82 
 
 
478 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  42.33 
 
 
447 aa  335  9e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  45.43 
 
 
444 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  41.92 
 
 
426 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  40.35 
 
 
447 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  41.28 
 
 
451 aa  306  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  41.31 
 
 
456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  39.57 
 
 
490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  42.39 
 
 
420 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  41.98 
 
 
419 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  39.08 
 
 
440 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  36.74 
 
 
416 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  36.77 
 
 
412 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  35.05 
 
 
413 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  36.53 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  35.51 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  34.28 
 
 
414 aa  233  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  34.43 
 
 
413 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  36.08 
 
 
425 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  36.25 
 
 
413 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  36 
 
 
420 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  35.91 
 
 
413 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  35.91 
 
 
413 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  36.67 
 
 
407 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  36.34 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  35.63 
 
 
391 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  33.33 
 
 
411 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  35.68 
 
 
408 aa  223  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  34.88 
 
 
417 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  37 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  35.68 
 
 
419 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  36.62 
 
 
405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.72 
 
 
411 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  35.45 
 
 
419 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34.12 
 
 
415 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  32.86 
 
 
411 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  34.92 
 
 
418 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.95 
 
 
411 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  33.81 
 
 
403 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  36.36 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  36.07 
 
 
425 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  33.71 
 
 
431 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  33.97 
 
 
409 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  32.63 
 
 
406 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  34.4 
 
 
428 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  34.07 
 
 
461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  36.93 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 
445 aa  183  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.74 
 
 
430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  34.75 
 
 
407 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  31.26 
 
 
443 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.6 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.47 
 
 
445 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.89 
 
 
426 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.74 
 
 
430 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.11 
 
 
405 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.98 
 
 
431 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.31 
 
 
426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  33.25 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.07 
 
 
440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.82 
 
 
444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  31.12 
 
 
459 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.62 
 
 
423 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  32.62 
 
 
438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.45 
 
 
413 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.03 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  31.28 
 
 
409 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  30.09 
 
 
407 aa  146  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  31.28 
 
 
409 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  31.28 
 
 
409 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.35 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  31.33 
 
 
429 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  30.17 
 
 
417 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  30.17 
 
 
417 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  30.17 
 
 
417 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  29.17 
 
 
400 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.71 
 
 
426 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  30.88 
 
 
419 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.12 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.57 
 
 
396 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  31.54 
 
 
433 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  30.67 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  29.93 
 
 
424 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  28.38 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.56 
 
 
412 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  30.31 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.61 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.03 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  29.75 
 
 
421 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.36 
 
 
407 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.9 
 
 
411 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>