More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0534 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  46.94 
 
 
799 aa  705  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  48.65 
 
 
796 aa  749  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.07 
 
 
820 aa  643  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  45.56 
 
 
759 aa  644  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  42.41 
 
 
840 aa  678  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  40.59 
 
 
834 aa  642  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.23 
 
 
836 aa  681  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.23 
 
 
836 aa  681  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  46.18 
 
 
837 aa  716  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  50.53 
 
 
760 aa  735  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  40.99 
 
 
839 aa  655  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  50.43 
 
 
806 aa  768  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  49.76 
 
 
797 aa  750  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  45.84 
 
 
836 aa  763  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 
866 aa  649  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  7.34074e-09  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
836 aa  693  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  40.95 
 
 
833 aa  658  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  48.22 
 
 
831 aa  687  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.67 
 
 
852 aa  657  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  43.49 
 
 
827 aa  664  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  52.44 
 
 
742 aa  785  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  40.75 
 
 
802 aa  658  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.73 
 
 
814 aa  697  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  49.14 
 
 
786 aa  706  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  42.6 
 
 
844 aa  648  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  45.07 
 
 
905 aa  780  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
833 aa  667  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  47.65 
 
 
810 aa  664  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  51.6 
 
 
743 aa  744  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
821 aa  683  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  47.43 
 
 
803 aa  745  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  49.33 
 
 
821 aa  774  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  44.09 
 
 
828 aa  684  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  47.92 
 
 
802 aa  754  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
885 aa  689  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.1796e-05 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 
827 aa  665  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  47.92 
 
 
802 aa  754  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  50.31 
 
 
805 aa  770  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.81926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
841 aa  640  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  49.88 
 
 
797 aa  771  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  48.09 
 
 
837 aa  679  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  49.34 
 
 
759 aa  711  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.28 
 
 
905 aa  700  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  46.22 
 
 
925 aa  680  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  49 
 
 
839 aa  706  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  46.39 
 
 
824 aa  783  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
867 aa  714  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  49.61 
 
 
859 aa  689  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  49.08 
 
 
817 aa  765  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  49.94 
 
 
837 aa  833  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.89142e-05  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  49.88 
 
 
798 aa  779  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  58.33 
 
 
894 aa  952  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  44.34 
 
 
828 aa  698  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  43.5 
 
 
1087 aa  635  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.28 
 
 
826 aa  690  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  54.75 
 
 
758 aa  814  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  58.7 
 
 
818 aa  969  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.93 
 
 
841 aa  666  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  50.86 
 
 
806 aa  768  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  49.34 
 
 
759 aa  711  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  47.67 
 
 
750 aa  706  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  44.24 
 
 
936 aa  756  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  50.86 
 
 
806 aa  770  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  3.37327e-05 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  50.74 
 
 
805 aa  774  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97644e-14 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  50.18 
 
 
798 aa  759  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  42.67 
 
 
976 aa  679  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  43.29 
 
 
849 aa  681  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
789 aa  677  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  46.21 
 
 
752 aa  697  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  42.79 
 
 
835 aa  656  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  51.28 
 
 
815 aa  789  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.16614e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  43.89 
 
 
826 aa  667  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  5.73179e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.56 
 
 
827 aa  693  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.92 
 
 
826 aa  673  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  41.73 
 
 
819 aa  662  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  43.43 
 
 
837 aa  698  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.02 
 
 
836 aa  704  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  48.21 
 
 
794 aa  748  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
814 aa  637  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  50.74 
 
 
805 aa  774  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.38 
 
 
826 aa  657  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 
855 aa  679  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  50.67 
 
 
805 aa  794  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  47.04 
 
 
954 aa  731  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  50.61 
 
 
805 aa  771  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  48.54 
 
 
891 aa  681  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  48.4 
 
 
753 aa  727  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  50.49 
 
 
805 aa  769  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.16421e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  42 
 
 
833 aa  678  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  45.53 
 
 
857 aa  743  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  51.14 
 
 
744 aa  751  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 
841 aa  646  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
868 aa  787  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  6.05467e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  50.18 
 
 
798 aa  759  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  50.61 
 
 
805 aa  771  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.48263e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  44.81 
 
 
747 aa  668  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  42.77 
 
 
834 aa  682  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  97.53 
 
 
889 aa  1746  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
889 aa  1783  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  47.64 
 
 
758 aa  684  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>