97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0148 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  100 
 
 
273 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  96.34 
 
 
273 aa  477  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  47.66 
 
 
267 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  46.88 
 
 
282 aa  224  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  48.4 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  43.21 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  47.95 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  41.86 
 
 
266 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  42.69 
 
 
266 aa  201  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  37.77 
 
 
344 aa  195  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  42.36 
 
 
279 aa  188  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  39.02 
 
 
270 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  37.64 
 
 
336 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  43.84 
 
 
294 aa  175  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  37.64 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  37.41 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.1 
 
 
307 aa  171  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  38.66 
 
 
286 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  37.18 
 
 
327 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  42.79 
 
 
260 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  36.19 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  43.19 
 
 
316 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  36.4 
 
 
269 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  37.83 
 
 
292 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  31.93 
 
 
324 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  33.71 
 
 
265 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  34.8 
 
 
365 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  52.99 
 
 
249 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  33.94 
 
 
337 aa  148  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  38.29 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  41.3 
 
 
377 aa  145  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  39.66 
 
 
381 aa  143  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  32.73 
 
 
395 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  55.75 
 
 
189 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  30.74 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  35.29 
 
 
384 aa  132  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  33.02 
 
 
377 aa  126  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  29.1 
 
 
308 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  35.54 
 
 
292 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  30.53 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  32.21 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.78 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  31.54 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.51 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.51 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  30.51 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.51 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.28 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.98 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.21 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  30.77 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  27.44 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  31.36 
 
 
197 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  29.05 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  29.66 
 
 
233 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  31.4 
 
 
206 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  31.67 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  24.77 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  25.42 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.91 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.91 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  34.07 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  26.27 
 
 
200 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.91 
 
 
210 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  24.77 
 
 
220 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.91 
 
 
210 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  26.8 
 
 
229 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  25.45 
 
 
210 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.31 
 
 
210 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.31 
 
 
210 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.31 
 
 
233 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  25.45 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  23.53 
 
 
323 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  32.59 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  27.69 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  30.82 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  25.7 
 
 
206 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  25.7 
 
 
206 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  24.65 
 
 
210 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  29.2 
 
 
210 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  28.03 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  23.74 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  29.6 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  28.37 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  28.08 
 
 
192 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  26.28 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  31.33 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  29.75 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  27.66 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  24.77 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  25.59 
 
 
203 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  26.76 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  21.09 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  25 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  26.09 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  23.53 
 
 
244 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  24.83 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>