52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0241 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  271  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  38.71 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  37.9 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  37.9 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  36 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2762  peptidase M15A  32.2 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31642  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  31.06 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  31.06 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1243  peptidase M15A  32.2 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.207822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2064  peptidase M15A  33.05 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.079322  normal  0.028661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  35 
 
 
347 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  41.89 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2911  peptidase M15A  32.2 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  36.75 
 
 
341 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  36.7 
 
 
1050 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  34.68 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  30.23 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  33 
 
 
356 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  34 
 
 
459 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  37.5 
 
 
421 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  36.56 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  42.19 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  43.64 
 
 
157 aa  53.5  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  35.78 
 
 
102 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  37.7 
 
 
426 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  31.97 
 
 
224 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  46 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  33.71 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  28.48 
 
 
355 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  35 
 
 
513 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  38.75 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  35.19 
 
 
540 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  34.29 
 
 
212 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  33.63 
 
 
541 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  31.75 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  31.43 
 
 
194 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  33.96 
 
 
529 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  33.96 
 
 
589 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  32.74 
 
 
526 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  42.86 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  30 
 
 
236 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4190  protein of unknown function DUF882  32.99 
 
 
256 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  45.65 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  52.5 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0990  hypothetical protein  31.86 
 
 
529 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  45.24 
 
 
255 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3192  protein of unknown function DUF882  31.37 
 
 
273 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559007  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  35.29 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  33.94 
 
 
195 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  30.39 
 
 
625 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6865  hypothetical protein  31.3 
 
 
544 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.034026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>