269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0056 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0097  flagellar motor switch protein FliY  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0056  flagellar motor switch protein FliY  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0069  flagellar motor switch protein FliY  97.44 
 
 
273 aa  540  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0238  flagellar motor switch protein FliY  71.06 
 
 
279 aa  392  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1019  flagellar motor switch protein FliY  55.6 
 
 
284 aa  297  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.239679  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1440  flagellar motor switch protein FliY  53.74 
 
 
286 aa  295  5e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  6.66151e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1513  flagellar motor switch protein FliY  52.69 
 
 
276 aa  276  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0298  flagellar motor switch protein FliN  45.94 
 
 
286 aa  231  8e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  2.18083e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0708  flagellar motor switch protein FliY  45.91 
 
 
283 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  44.83 
 
 
401 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  51.76 
 
 
137 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.14 
 
 
346 aa  85.9  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44.14 
 
 
346 aa  86.3  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  28.46 
 
 
411 aa  84  2e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  50.6 
 
 
402 aa  83.2  5e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  40.66 
 
 
393 aa  82  9e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  42.71 
 
 
375 aa  81.6  1e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.71 
 
 
357 aa  81.3  1e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  44.83 
 
 
393 aa  81.3  1e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  26.46 
 
 
372 aa  81.3  2e-14  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  50.62 
 
 
406 aa  80.9  2e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.94996e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  41.24 
 
 
99 aa  79.3  6e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 
375 aa  79.3  7e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.43 
 
 
422 aa  79  8e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  44.05 
 
 
188 aa  79  8e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  44.05 
 
 
99 aa  78.2  1e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  42.35 
 
 
97 aa  77.8  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.32 
 
 
370 aa  77.4  2e-13  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 
378 aa  77.4  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  48.78 
 
 
572 aa  77.4  2e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  42.86 
 
 
101 aa  77  3e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
103 aa  77  3e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  41.18 
 
 
97 aa  76.6  4e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  39.77 
 
 
103 aa  76.6  4e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  31.25 
 
 
153 aa  76.6  4e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  41.18 
 
 
97 aa  76.6  4e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  39.77 
 
 
381 aa  76.3  5e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 
101 aa  76.3  5e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 
101 aa  76.3  5e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.91 
 
 
375 aa  76.3  5e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  43.75 
 
 
359 aa  76.3  6e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0411  flagellar motor switch protein FliN  43.21 
 
 
84 aa  76.3  6e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.860809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  43.21 
 
 
111 aa  75.9  7e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  37.78 
 
 
226 aa  75.9  7e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  43.53 
 
 
395 aa  75.9  7e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  40.91 
 
 
155 aa  75.9  7e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
101 aa  75.9  8e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  43.21 
 
 
109 aa  75.5  8e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  36.47 
 
 
155 aa  75.5  9e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  42.86 
 
 
175 aa  75.1  1e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  35.48 
 
 
135 aa  74.3  2e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
137 aa  73.9  2e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  40 
 
 
398 aa  74.3  2e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  35.63 
 
 
157 aa  74.3  2e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
137 aa  74.3  2e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.02287e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
137 aa  74.3  2e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 
138 aa  73.9  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
137 aa  73.9  2e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.12484e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
137 aa  74.3  2e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  44.32 
 
 
137 aa  74.7  2e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
137 aa  73.9  2e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 
137 aa  74.3  2e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
137 aa  73.9  2e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 
138 aa  73.9  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
137 aa  74.3  2e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  35.63 
 
 
157 aa  73.9  2e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  34.02 
 
 
154 aa  74.3  2e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 
161 aa  73.9  3e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  32.52 
 
 
153 aa  73.9  3e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 
154 aa  73.6  3e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  40.48 
 
 
170 aa  73.6  3e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 
174 aa  73.6  3e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 
154 aa  73.9  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 
137 aa  73.9  3e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  40.48 
 
 
180 aa  73.6  3e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  40.48 
 
 
190 aa  73.9  3e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  35.71 
 
 
152 aa  73.2  4e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  43.37 
 
 
360 aa  73.2  4e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  42.7 
 
 
137 aa  72.8  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  42.7 
 
 
137 aa  72.8  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  42.7 
 
 
137 aa  72.8  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  35.56 
 
 
154 aa  72.8  5e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 
152 aa  73.2  5e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.67 
 
 
175 aa  73.2  5e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  42.7 
 
 
137 aa  72.8  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  42.7 
 
 
137 aa  72.8  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  42.35 
 
 
138 aa  72.4  7e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  35.71 
 
 
152 aa  72.4  7e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  31.78 
 
 
131 aa  72.4  7e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  44.05 
 
 
136 aa  72  9e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  34.52 
 
 
135 aa  71.6  1e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  35.63 
 
 
166 aa  72  1e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  35.23 
 
 
136 aa  72  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  31.96 
 
 
127 aa  72  1e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  34.09 
 
 
138 aa  71.6  1e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  35.23 
 
 
136 aa  72  1e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  34.09 
 
 
126 aa  70.9  2e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  38.1 
 
 
139 aa  71.2  2e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  33.71 
 
 
124 aa  71.2  2e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.9 
 
 
143 aa  71.2  2e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>