More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0001 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  98.18 
 
 
440 aa  877  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
440 aa  891  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  99.55 
 
 
440 aa  887  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  69.32 
 
 
442 aa  625  1e-178  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  61.78 
 
 
436 aa  565  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  59.5 
 
 
436 aa  544  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1853  chromosomal replication initiation protein  59.36 
 
 
436 aa  532  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.31 
 
 
441 aa  508  1e-142  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  49.08 
 
 
435 aa  435  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.77 
 
 
437 aa  396  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  37.44 
 
 
450 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  36.49 
 
 
450 aa  320  4e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  37.69 
 
 
458 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  37.53 
 
 
460 aa  315  1e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  38.69 
 
 
443 aa  313  4e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  36.96 
 
 
446 aa  308  1e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.96 
 
 
446 aa  308  1e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.02 
 
 
446 aa  307  2e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.02 
 
 
446 aa  307  2e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  36.79 
 
 
446 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  36.79 
 
 
446 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  36.79 
 
 
446 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  36.79 
 
 
446 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  36.79 
 
 
446 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  37.78 
 
 
449 aa  306  4e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 
450 aa  305  1e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  36.94 
 
 
445 aa  305  1e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  37.13 
 
 
446 aa  305  1e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  36.47 
 
 
446 aa  304  2e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.12 
 
 
453 aa  299  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.82 
 
 
443 aa  296  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  37.41 
 
 
442 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.18 
 
 
463 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.57 
 
 
446 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  36.53 
 
 
445 aa  292  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  35.14 
 
 
452 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  35.04 
 
 
459 aa  289  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  39.65 
 
 
457 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  36.12 
 
 
441 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  35.1 
 
 
436 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  39.36 
 
 
457 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.84 
 
 
444 aa  285  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  36.24 
 
 
451 aa  285  1e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
453 aa  284  2e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
453 aa  284  2e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  33.19 
 
 
482 aa  283  4e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.05 
 
 
454 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.42 
 
 
503 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.23 
 
 
454 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  41.89 
 
 
464 aa  281  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.3935e-05  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  35.14 
 
 
450 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.22878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  40.64 
 
 
443 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  34.29 
 
 
460 aa  279  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.76 
 
 
458 aa  279  9e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
460 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.28 
 
 
591 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.28 
 
 
587 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.62 
 
 
449 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.01 
 
 
459 aa  276  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.13 
 
 
480 aa  276  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  39.47 
 
 
615 aa  275  1e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  4.79277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  38.42 
 
 
440 aa  275  1e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.38 
 
 
461 aa  275  1e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  32.89 
 
 
460 aa  274  2e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  40.35 
 
 
490 aa  274  2e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.64 
 
 
566 aa  274  2e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  32.89 
 
 
460 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.65 
 
 
474 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  3.98294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  39.94 
 
 
477 aa  274  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  32.35 
 
 
451 aa  273  4e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  32.89 
 
 
461 aa  273  4e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  34.4 
 
 
455 aa  273  4e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.65 
 
 
473 aa  273  5e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.84064e-14 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  32.6 
 
 
465 aa  272  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.56 
 
 
464 aa  272  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  32.66 
 
 
460 aa  272  8e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  32.51 
 
 
460 aa  272  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.06 
 
 
515 aa  272  9e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  33.04 
 
 
462 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  38.4 
 
 
492 aa  271  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  33.04 
 
 
462 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.95 
 
 
528 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  33.04 
 
 
462 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  33.04 
 
 
462 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  38.82 
 
 
440 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  33.04 
 
 
465 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 
463 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  38.11 
 
 
524 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  31.47 
 
 
462 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.11976e-10  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  32.21 
 
 
461 aa  270  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  31.88 
 
 
449 aa  270  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  38.53 
 
 
491 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  35.69 
 
 
478 aa  270  6e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  32.21 
 
 
461 aa  269  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.47 
 
 
527 aa  269  9e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.39 
 
 
462 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.69 
 
 
652 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  5.05913e-06  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  36.66 
 
 
472 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.26 
 
 
518 aa  268  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.28 
 
 
721 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>