More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3333 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  100 
 
 
280 aa  570  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  59.27 
 
 
286 aa  321  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  58.03 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  57.66 
 
 
280 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  57.51 
 
 
280 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  58.03 
 
 
284 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  55.04 
 
 
284 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 
284 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.71 
 
 
287 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.08 
 
 
279 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
280 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
279 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 
276 aa  261  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  52.99 
 
 
284 aa  258  5.0000000000000005e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  50.2 
 
 
282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.34 
 
 
276 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 
285 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.13 
 
 
276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
284 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  44.6 
 
 
287 aa  241  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  44.73 
 
 
278 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 
279 aa  239  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.63 
 
 
274 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  45.66 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
272 aa  235  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  47.76 
 
 
274 aa  235  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 
286 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
276 aa  231  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.98 
 
 
282 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 
277 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
279 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
276 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.57 
 
 
279 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.19 
 
 
285 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
276 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
282 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
281 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  43.12 
 
 
274 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  45.13 
 
 
277 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  43.12 
 
 
274 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.52 
 
 
282 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  43.33 
 
 
274 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
292 aa  224  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  46.24 
 
 
276 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  46.32 
 
 
280 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
276 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 
286 aa  223  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  45.11 
 
 
276 aa  221  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
281 aa  221  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.2 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  45.15 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 
275 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  44.2 
 
 
277 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 
288 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
274 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 
290 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 
276 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  42.03 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  42.03 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 
274 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  42.03 
 
 
277 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
277 aa  208  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.38 
 
 
268 aa  208  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
291 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
281 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
283 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 
303 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
296 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
278 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  38.83 
 
 
275 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
273 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
277 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
277 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
275 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 
296 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
279 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
280 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 
287 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
281 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 
282 aa  201  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
291 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
284 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.28 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>