235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2511 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  48.31 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  40.45 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  41.57 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  45.56 
 
 		 201 aa  148  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  38.59 
 
 		 212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  39.89 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  40.22 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  36.46 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  35.88 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0003  hypothetical protein  44.51 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606692  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.16 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  34.07 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  36.52 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  37.65 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  34.48 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.35 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  36.08 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  35.15 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  36.99 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  34.22 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  47.46 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.5 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  34.21 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  36.3 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  36.3 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  36.3 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  34.04 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.3 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  36.3 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  36.3 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.3 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.3 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  36.3 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  36.07 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  36.99 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  31.21 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  31.49 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  35.19 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  30.34 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  34.57 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  31.79 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  35.29 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  42 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  39.53 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  31.11 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  31.84 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  30.46 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  33.75 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  37.57 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.66 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  32.16 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  32.42 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  32.16 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  36.75 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  33.53 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  33.7 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  31.28 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  27.87 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  32.53 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  31.95 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  30.99 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  28.57 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  31.69 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  34.44 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  31.82 
 
 		 290 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  98.2  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  35.84 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  30.6 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  31.52 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  30.99 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1321  hypothetical protein  32.24 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.353433  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  42.4 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  32.67 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  32.39 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  42.31 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  30.98 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  38.33 
 
 		 208 aa  95.1  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  32.16 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  30.68 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  29.44 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  31.48 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  30.86 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  30.9 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  29.89 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  35.38 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  32.5 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  31.76 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  30.68 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  30.68 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  30.18 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  30.68 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  28.18 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  40.65 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  31.33 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  29.69 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0142  protein of unknown function UPF0029  31.02 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>