290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2443 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  47.56 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 
117 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  44.32 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  45.78 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  56.52 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  45.92 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  41.77 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  47.22 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  49.37 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  39.18 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  45.12 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
86 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  32.61 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  42.25 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
114 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  35.16 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  37.08 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  43.84 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  43.84 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  43.84 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  43.84 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  43.84 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  44.74 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  43.84 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  55.1 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  37.33 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  38.89 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  42.47 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  42.47 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  42.47 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  41.89 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  34.21 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  47.69 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  34.21 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  42.05 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  33.33 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  52.08 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  35.53 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0942  preprotein translocase, YajC subunit  40.79 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.129581  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  52.08 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  39.73 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4927  preprotein translocase, YajC subunit  52.86 
 
 
84 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354289  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  38.03 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  34.21 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  34.21 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  40.28 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  36.11 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  39.24 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 
108 aa  58.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  35.14 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  33.78 
 
 
92 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31.4 
 
 
109 aa  57.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  36.62 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  36.11 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  34.52 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40.54 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  32 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  32.56 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  37.33 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  37.84 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  32.56 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  27.96 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>