182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1851 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
85 aa  163  7e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  71.43 
 
 
87 aa  115  2e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.77404e-11  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  72.29 
 
 
84 aa  112  2e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  62.65 
 
 
83 aa  98.2  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  65.48 
 
 
85 aa  97.1  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  65.06 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  4.52156e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  60.24 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  57.5 
 
 
82 aa  83.2  1e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  53.57 
 
 
84 aa  78.2  4e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  53.57 
 
 
84 aa  77.4  6e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  48.81 
 
 
84 aa  75.9  2e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.67926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 
87 aa  67  7e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  61.2  5e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.04078e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  41.46 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 
99 aa  59.7  1e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.25202e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  59.3  2e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.8734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  43.02 
 
 
88 aa  58.9  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  44.19 
 
 
86 aa  57.8  4e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
86 aa  57.4  6e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
86 aa  57.4  6e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
86 aa  57.4  6e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
86 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  55.5  2e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.68382e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  41.86 
 
 
86 aa  55.1  3e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  55.1  3e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
86 aa  54.7  4e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  40.96 
 
 
88 aa  54.7  4e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
86 aa  54.3  5e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  36.78 
 
 
92 aa  53.9  6e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 
90 aa  54.3  6e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.26326e-09  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
86 aa  53.9  8e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  40.7 
 
 
86 aa  53.5  1e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  53.1  1e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 
90 aa  52.8  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 
88 aa  52.4  2e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
86 aa  52.4  2e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 
89 aa  52  3e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  36.36 
 
 
88 aa  51.6  3e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  39.53 
 
 
86 aa  52  3e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
93 aa  51.6  3e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  42.35 
 
 
88 aa  52  3e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 
88 aa  52  3e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  51.6  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.10534e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  40.74 
 
 
86 aa  51.6  4e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  40.26 
 
 
77 aa  51.6  4e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 
86 aa  51.2  5e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
86 aa  51.2  5e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  39.76 
 
 
115 aa  50.8  6e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  5.62255e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  50.8  6e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  50.8  6e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  43.75 
 
 
91 aa  50.8  7e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 
87 aa  49.7  1e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.71927e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  37.21 
 
 
92 aa  50.1  1e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 
87 aa  49.7  1e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31209e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 
87 aa  48.9  2e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  4.43906e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  39.02 
 
 
89 aa  49.3  2e-05  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  37.97 
 
 
87 aa  48.5  3e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  35.9 
 
 
83 aa  48.5  3e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
94 aa  48.1  4e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7573e-05 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
89 aa  48.1  4e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  39.08 
 
 
88 aa  47.8  5e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
97 aa  47.8  5e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 
88 aa  47.8  6e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  37.66 
 
 
151 aa  47.4  6e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 
88 aa  47.4  7e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  47  8e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
97 aa  47.4  8e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  36.05 
 
 
162 aa  47  9e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.27538e-06  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  38.37 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.91712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53456e-13 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  39.08 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  7.87873e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  38.27 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  41.67 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  35.44 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  36.05 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  34.09 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.96831e-11  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  37.66 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  1.16553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  37.66 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  34.09 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  1.17943e-11 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>