293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0074 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  100 
 
 		 309 aa  625  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  61.69 
 
 		 311 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  60.32 
 
 		 311 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  58.44 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  54.14 
 
 		 320 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  52.2 
 
 		 320 aa  328  8e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  52.2 
 
 		 320 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  52.2 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  52.2 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  54.78 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  55.05 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  51.91 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  50.49 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  51.79 
 
 		 311 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  42.41 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  37.46 
 
 		 325 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  36.52 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  36.52 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  36.52 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  35.46 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  37.17 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  37.17 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  35.28 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  39.93 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  34.19 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  35.74 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  39.46 
 
 		 296 aa  172  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  36.61 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  35.25 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  35.24 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  34.3 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  34.3 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  34.92 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  34.3 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  34.3 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  34.3 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  34.08 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  34.08 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  39.03 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  34.69 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  35.26 
 
 		 323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  33.76 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  33.76 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  33.76 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  33.76 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  33.76 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  33.76 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  33.76 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  38.6 
 
 		 301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  34.74 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  34.6 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  37.87 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  37.88 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  37.5 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  39.53 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  37.25 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  33.85 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  33.44 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  35.02 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  34.8 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  34 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  35.12 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  33.55 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  33.89 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  34.92 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  33.67 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  33.01 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  39.26 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  32.27 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  38.1 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  35.35 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  33.67 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  32.46 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  31.43 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  33.77 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  32.87 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  32.67 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  35.24 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  35.56 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  32.37 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  32.65 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  34.69 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  30.97 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  32.37 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  32.59 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  31.29 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1078  homoserine kinase  37.08 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  0.147957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  32.14 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  32.05 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  32.05 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0054  homoserine kinase  35.02 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  30.35 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  33.01 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  34.05 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  30.03 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  35 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  30.13 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  32.48 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  31.13 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  31.94 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>