More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1041 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  52.92 
 
 
700 aa  721    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  52.49 
 
 
700 aa  717    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  53.06 
 
 
700 aa  724    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
731 aa  1476    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  48.98 
 
 
678 aa  443  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  36.39 
 
 
694 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  51.28 
 
 
656 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  49.71 
 
 
657 aa  437  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  61.29 
 
 
658 aa  431  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  63.66 
 
 
660 aa  430  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  52.63 
 
 
659 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  52.63 
 
 
659 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  59.18 
 
 
653 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  53.96 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  57.58 
 
 
651 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  58.07 
 
 
665 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  45.99 
 
 
662 aa  398  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  58.64 
 
 
664 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  51.6 
 
 
596 aa  359  9.999999999999999e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  43.47 
 
 
653 aa  357  3.9999999999999996e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  54.9 
 
 
544 aa  356  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  44.63 
 
 
652 aa  352  1e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  54.14 
 
 
545 aa  346  8.999999999999999e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  53.28 
 
 
657 aa  342  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 
649 aa  331  4e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  39.65 
 
 
655 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  39.65 
 
 
655 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  44.3 
 
 
663 aa  320  5e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  38.87 
 
 
654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  39.1 
 
 
654 aa  303  9e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  46.45 
 
 
651 aa  297  4e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  44.86 
 
 
656 aa  297  5e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  61.02 
 
 
236 aa  283  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  45.64 
 
 
604 aa  279  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 
663 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  42.61 
 
 
553 aa  238  4e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  31.53 
 
 
656 aa  139  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.61 
 
 
832 aa  138  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 
627 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 
621 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.18 
 
 
682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
656 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.03 
 
 
658 aa  128  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.02 
 
 
630 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 
708 aa  127  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 
713 aa  126  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1200  methyl-accepting chemotaxis protein  26.03 
 
 
728 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 
541 aa  124  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  40.5 
 
 
650 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.24 
 
 
665 aa  123  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.57 
 
 
530 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  36.67 
 
 
661 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.93 
 
 
674 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000495749  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  60.61 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
530 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.47 
 
 
421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.36 
 
 
625 aa  122  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  49.65 
 
 
546 aa  122  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 
372 aa  122  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  48.23 
 
 
625 aa  122  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  37.73 
 
 
566 aa  120  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  33.68 
 
 
549 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1253  methyl-accepting chemotaxis protein  42 
 
 
429 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1128  methyl-accepting chemotaxis protein  42 
 
 
429 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0612  methyl-accepting chemotaxis protein  46.91 
 
 
429 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  40 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.59 
 
 
675 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1201  methyl-accepting chemotaxis protein  22.37 
 
 
728 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1608  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 
563 aa  118  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.74 
 
 
785 aa  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
633 aa  118  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.74 
 
 
778 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0947231 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 
540 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 
648 aa  118  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.59059  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 
357 aa  117  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 
542 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  34.84 
 
 
645 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  50.82 
 
 
536 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  41.18 
 
 
528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 
547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 
705 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.807181  normal  0.137814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 
561 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182871  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0562  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.75 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.69 
 
 
597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.45 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 
720 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  48.03 
 
 
563 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3136  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.27 
 
 
678 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.49 
 
 
659 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 
655 aa  116  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 
557 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  62.37 
 
 
626 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4817  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 
747 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849638 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  61.22 
 
 
306 aa  114  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  49.22 
 
 
365 aa  114  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05406  histidine kinase/response regulator hybrid protein  32.67 
 
 
666 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>