More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0969 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
263 aa  533  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 
260 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  53.99 
 
 
265 aa  265  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.85147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  55.43 
 
 
264 aa  258  7e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  52.12 
 
 
267 aa  254  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
270 aa  251  8e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  46.88 
 
 
270 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 
257 aa  239  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 
262 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
270 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
272 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
270 aa  234  7e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
270 aa  234  1e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
264 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
264 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
260 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
267 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
284 aa  221  1e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
264 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 
266 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 
270 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
264 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
268 aa  215  6e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
268 aa  214  1e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
268 aa  213  2e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  47.52 
 
 
269 aa  213  2e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
266 aa  213  3e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
270 aa  212  4e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 
271 aa  212  4e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
268 aa  212  6e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 
269 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 
271 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
260 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 
285 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 
288 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 
267 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  40.84 
 
 
264 aa  205  8e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
263 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  43.87 
 
 
531 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
286 aa  201  1e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
268 aa  200  2e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 
288 aa  200  2e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 
288 aa  200  2e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  45.97 
 
 
269 aa  200  2e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
295 aa  200  2e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  45.97 
 
 
269 aa  200  2e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
285 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
490 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 
269 aa  199  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 
497 aa  198  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
268 aa  197  1e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 
271 aa  196  2e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 
267 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  38.71 
 
 
510 aa  196  4e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  43.59 
 
 
518 aa  196  4e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35123e-15 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 
436 aa  195  6e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
270 aa  194  9e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
283 aa  194  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
270 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 
270 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  42.01 
 
 
290 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 
269 aa  193  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
272 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 
297 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
266 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
266 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
266 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
266 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
266 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
266 aa  192  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  41.98 
 
 
266 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
266 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
266 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 
270 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
497 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  42.58 
 
 
267 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.61 
 
 
273 aa  191  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 
266 aa  191  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 
269 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
266 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
275 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
265 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 
262 aa  190  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
266 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  40.54 
 
 
270 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
274 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 
266 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  42.7 
 
 
266 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 
267 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
283 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
271 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 
278 aa  188  6e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  41.25 
 
 
265 aa  188  6e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  41.25 
 
 
273 aa  189  6e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 
268 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>