More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1280 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  75 
 
 		 220 aa  340  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  58.26 
 
 		 221 aa  237  8e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  57.84 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  57.84 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  56.37 
 
 		 221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  49.32 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  49.54 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  49.09 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0528  transcriptional activator protein CopR  55 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  45.41 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  36.74 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  36.57 
 
 		 219 aa  147  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  35.78 
 
 		 219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  34.72 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  35.32 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  36.41 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.36 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3511  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.41 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0583  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  0.467543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.34 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0660  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000270487 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  35.75 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  35.29 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3294  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.16 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0118223  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.1 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  34.26 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.6 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 224 aa  134  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  34.84 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.45 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0616  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0199047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3414  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00145574  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0615  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0124209  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0622  DNA-binding response regulator  34.36 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0576  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00494054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3749  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.545663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3692  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.7 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0674602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3875  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000900168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  34.65 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0650  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000493918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6736  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.523736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 224 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 652 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  35.61 
 
 		 799 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  36.41 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  29.49 
 
 		 220 aa  131  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2350  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.27 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1845  DNA-binding response regulator  34.67 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0241  two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0124  two component transcriptional regulator  29.68 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  38.07 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  31.84 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0856  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  31.34 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3875  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000754116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  31.86 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  32.87 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3209  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory proteinphoP  35.02 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  36.4 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.42 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>