More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0810 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  100 
 
 		 425 aa  859    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  82.32 
 
 		 413 aa  709    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  64.71 
 
 		 410 aa  531  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  57.7 
 
 		 412 aa  474  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  51.82 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  49.39 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  50.12 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  49.23 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  48.72 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  35.73 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  33.82 
 
 		 415 aa  213  7e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  32.6 
 
 		 420 aa  199  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  31.49 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  32.12 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  30.34 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  38.81 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 405 aa  169  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  32.6 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  32.28 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  33.09 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  28.18 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  27.54 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  27.41 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  26.8 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  26.8 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  24.74 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  26.37 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  26.25 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  27.65 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  23.02 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  27.03 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.32 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.34 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  27.03 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  21.32 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  26.37 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  26.17 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  25.95 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  25.38 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  25.41 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  24.14 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  27.12 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  29.1 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.97 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  27.59 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  21.09 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  23.38 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  25.44 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  25 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  26.04 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.3 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  23.78 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  27.21 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  24.03 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  24.72 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  25 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  23.62 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4794  histidine kinase  24.28 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  26.53 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  26.53 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  26.53 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  26.53 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  23.64 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  25.55 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  26.12 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  26.53 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  26.12 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  26.12 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  26.12 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  26.12 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  23.64 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  26.12 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  26.12 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  22.5 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  24.63 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  26.12 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  24.32 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  26.55 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>