73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2136 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  57.58 
 
 		 200 aa  227  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  56.57 
 
 		 199 aa  204  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  48 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  39.78 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  39.78 
 
 		 190 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  43.37 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  38.71 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  40 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  32.65 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  31.53 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  33.33 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  31.31 
 
 		 195 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  34 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  32.18 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  32.49 
 
 		 190 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  32.49 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  33.33 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  32.47 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  32.5 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  28.37 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  30 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.8 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  30.85 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  30.49 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  30.95 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  30.65 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.29 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  25.96 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  32 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  33.16 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  31.82 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  28.43 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.89 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  27.67 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  28.64 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  27.32 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  27.92 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  29.19 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  30.73 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  29.21 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  29.06 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  38.1 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  36 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  36 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  23.59 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  31.53 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  30.19 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  40.32 
 
 		 74 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  36.76 
 
 		 72 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  42.31 
 
 		 79 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  27.37 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  37.14 
 
 		 71 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  37.93 
 
 		 73 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  32.86 
 
 		 72 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  33.33 
 
 		 80 aa  45.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  33.33 
 
 		 80 aa  45.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  28.38 
 
 		 80 aa  45.1  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  32.43 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  48.39 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  34.48 
 
 		 70 aa  42.4  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  27.94 
 
 		 77 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  28.36 
 
 		 213 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  37.25 
 
 		 74 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  36.51 
 
 		 69 aa  42  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  48.39 
 
 		 186 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  32.84 
 
 		 73 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  45.16 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  32.26 
 
 		 78 aa  41.6  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  48.39 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  33.33 
 
 		 81 aa  41.6  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  35.21 
 
 		 72 aa  41.6  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  50 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>