More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1403 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  100 
 
 
403 aa  813  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  85.36 
 
 
403 aa  664  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.12424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  73.2 
 
 
403 aa  603  1e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  70.97 
 
 
403 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  70.97 
 
 
403 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  71.22 
 
 
403 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  70.57 
 
 
403 aa  582  1e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  67.49 
 
 
403 aa  561  1e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  73.2 
 
 
537 aa  553  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  61.21 
 
 
400 aa  485  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  48.87 
 
 
405 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  44.91 
 
 
403 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  44.58 
 
 
403 aa  347  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  45.02 
 
 
403 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.21864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.91 
 
 
403 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  44.91 
 
 
403 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  46.1 
 
 
402 aa  337  2e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.2395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  49.37 
 
 
401 aa  327  2e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  49.37 
 
 
401 aa  327  2e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  44.91 
 
 
403 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  45.84 
 
 
403 aa  322  6e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  43.92 
 
 
402 aa  322  6e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  45.09 
 
 
402 aa  321  1e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  45.34 
 
 
403 aa  321  1e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  43.92 
 
 
402 aa  320  4e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  7.1198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  45.02 
 
 
401 aa  318  8e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  42.82 
 
 
404 aa  314  2e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  47.38 
 
 
413 aa  312  7e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  45.09 
 
 
402 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  41.35 
 
 
402 aa  307  2e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  43.87 
 
 
443 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  42.46 
 
 
406 aa  305  8e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.48333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  43.32 
 
 
403 aa  305  1e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  44.39 
 
 
406 aa  305  1e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  43.83 
 
 
399 aa  304  2e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  44.25 
 
 
412 aa  303  3e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.15 
 
 
408 aa  303  4e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  43.5 
 
 
402 aa  303  4e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.60563e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  45.84 
 
 
402 aa  302  5e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  45 
 
 
412 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  41.25 
 
 
401 aa  299  5e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  45.59 
 
 
402 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  43.72 
 
 
400 aa  299  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  45.34 
 
 
402 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  43.28 
 
 
400 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  42.25 
 
 
402 aa  295  7e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  43.96 
 
 
395 aa  295  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  40.95 
 
 
402 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  43.18 
 
 
409 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  45.6 
 
 
404 aa  292  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.39723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  45.09 
 
 
402 aa  292  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  43.03 
 
 
403 aa  290  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  42.09 
 
 
415 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  42.82 
 
 
406 aa  289  5e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  44.5 
 
 
410 aa  288  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.42 
 
 
410 aa  288  9e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  44.16 
 
 
402 aa  284  2e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  39.25 
 
 
403 aa  283  3e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  43.08 
 
 
412 aa  283  3e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  40.69 
 
 
415 aa  283  5e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  3.23756e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  42.17 
 
 
411 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  42.75 
 
 
401 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  44.22 
 
 
415 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  41.15 
 
 
418 aa  280  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  42.08 
 
 
411 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  44.02 
 
 
399 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  43.47 
 
 
402 aa  277  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  44.02 
 
 
399 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  42.03 
 
 
408 aa  276  6e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  43.19 
 
 
412 aa  275  1e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  42.86 
 
 
421 aa  275  1e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  39.36 
 
 
408 aa  269  6e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  42.36 
 
 
407 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  41.56 
 
 
400 aa  267  3e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  41.05 
 
 
416 aa  265  9e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  46.44 
 
 
346 aa  262  7e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  46.44 
 
 
346 aa  262  7e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  38.35 
 
 
402 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  43.12 
 
 
403 aa  261  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  41.99 
 
 
408 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  40.4 
 
 
405 aa  259  5e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  41.81 
 
 
403 aa  259  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  40.15 
 
 
404 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  42.3 
 
 
403 aa  256  5e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  42.58 
 
 
414 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  41.92 
 
 
415 aa  255  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  39.7 
 
 
421 aa  255  1e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  38.81 
 
 
404 aa  254  2e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  2.83159e-06 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  40.75 
 
 
416 aa  254  2e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  40.05 
 
 
422 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  37.53 
 
 
507 aa  253  4e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  38.69 
 
 
404 aa  253  5e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  42.22 
 
 
415 aa  253  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  41.42 
 
 
423 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  40.9 
 
 
415 aa  250  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  34.83 
 
 
509 aa  249  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  39.65 
 
 
412 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  39.34 
 
 
410 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  39.14 
 
 
410 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  44.97 
 
 
358 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>