More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05285 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
404 aa  833    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.75 
 
 
401 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.43 
 
 
402 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.75 
 
 
401 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.96 
 
 
412 aa  485  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.21 
 
 
400 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.21 
 
 
401 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.25 
 
 
400 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.21 
 
 
401 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.21 
 
 
401 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.72 
 
 
401 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.21 
 
 
401 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.32 
 
 
404 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.71 
 
 
405 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.71 
 
 
401 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.21 
 
 
400 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.21 
 
 
401 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.46 
 
 
406 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58 
 
 
400 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.71 
 
 
401 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.72 
 
 
400 aa  474  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.72 
 
 
400 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.61 
 
 
401 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.72 
 
 
404 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.47 
 
 
400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.21 
 
 
400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 
400 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.72 
 
 
399 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 
400 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.96 
 
 
403 aa  464  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 
400 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.97 
 
 
399 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.47 
 
 
401 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.75 
 
 
406 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.97 
 
 
400 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.5 
 
 
406 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.47 
 
 
400 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.47 
 
 
399 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  56.44 
 
 
403 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 
400 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  55.69 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 
406 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.81 
 
 
404 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.23 
 
 
405 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.23 
 
 
400 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  56.11 
 
 
402 aa  456  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.73 
 
 
400 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  56.58 
 
 
400 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.98 
 
 
400 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 
402 aa  454  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  55.09 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.98 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.75 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.73 
 
 
400 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.99 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.73 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.73 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 
401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.47 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.73 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.47 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.5 
 
 
409 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5019  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.75 
 
 
400 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.582505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 
402 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 
400 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000820943  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.99 
 
 
400 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.48 
 
 
399 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.21 
 
 
401 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
398 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.22 
 
 
401 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.73 
 
 
400 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.75 
 
 
402 aa  448  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.22 
 
 
406 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 
398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.23 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.73 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.73 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.98 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1831  acetyl-CoA acetyltransferase  53.54 
 
 
403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.76791  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.73 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.6 
 
 
402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.98 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.98 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00256596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0916  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.71 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.35 
 
 
402 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>