169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1110 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 305 aa  594  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  97.7 
 
 		 305 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  87.67 
 
 		 306 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  44.25 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  41.99 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  43.9 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  43.16 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  42.7 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 		 339 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.31 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  43.66 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  40.14 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.51 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  43.66 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  35.76 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  40.31 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.78 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.71 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  42.2 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  42.25 
 
 		 640 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 294 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  38.06 
 
 		 304 aa  172  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  41.46 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.56 
 
 		 584 aa  168  9e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  36.01 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.2 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.69 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  35.96 
 
 		 311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  35.96 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  36.56 
 
 		 120 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  27.3 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 377 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  27.27 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  31.49 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  38.46 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  37.18 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2053  inner-membrane translocator  28.19 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.377779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1454  Monosaccharide-transporting ATPase  26.67 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 357 aa  46.6  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4470  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>