More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0322 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1463  short chain enoyl-CoA hydratase  68.36 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.225465  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 
256 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  41.02 
 
 
259 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
256 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  40.4 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
259 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
257 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  39.46 
 
 
261 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 
267 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
259 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  39.08 
 
 
261 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  39.08 
 
 
261 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  38.7 
 
 
261 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
259 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  38.7 
 
 
261 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.7 
 
 
297 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
273 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.7 
 
 
261 aa  165  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.7 
 
 
297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  38.7 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  38.7 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  38.7 
 
 
297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  38.7 
 
 
261 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  38.7 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.43 
 
 
260 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.05 
 
 
260 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  38.31 
 
 
261 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  37.93 
 
 
261 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
258 aa  159  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
260 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
257 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
266 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
253 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 
263 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
257 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
247 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
247 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
247 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 
258 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
249 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
268 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  40.41 
 
 
262 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
249 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
249 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
261 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
269 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  35.66 
 
 
264 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
270 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 
254 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.96 
 
 
256 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
253 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
256 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
266 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
273 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  37.05 
 
 
283 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
254 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.11 
 
 
255 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
256 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
254 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
255 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.72 
 
 
255 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
261 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
797 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.33 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.62 
 
 
260 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.29 
 
 
275 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
257 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.67 
 
 
257 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 
261 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.84 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.84 
 
 
257 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
270 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
263 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
270 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
258 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
270 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
262 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
258 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
258 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
257 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
268 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
254 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
254 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
260 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
285 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>